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pH对酿酒酵母转录组的影响

发布时间:2021-03-26 06:15
  为研究不同pH对酿酒酵母基因表达的影响,选用了 Pach培养基和麦芽汁培养基,在5L的发酵罐中分别在pH3.0、4.0、4.5、5.0、5.5、6.0、6.5、7.0、8.0、9.0条件下进行有氧培养,通过测序分析了不同pH条件下酿酒酵母的转录组。结果表明:在Pach培养基中,pH3.0与其它pH间差异表达的基因有 1416、1363、2026、3324、1925、3025、3159、3626、3104个。在 GO 数据库分别注释到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、2113 个功能。在 KEGG数据库定位到 485、532、712、1217、795、1171、955、899、1111个代谢途径;在麦芽汁培养基中,pH3.0与其它pH间差异表达的基因有 1658、1824、1547、2003、2268、2169、1621、2405、2118 个。在 GO 数据库分别注释到 1654、1817、1544、1993、2259、2162、1619、2392、211 3 个功能。在 KEGG 数据库中定位到 612、673、575、695、830、... 

【文章来源】:内蒙古农业大学内蒙古自治区

【文章页数】:48 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

pH对酿酒酵母转录组的影响


图1生长曲线??Fig.?1?growth?curve??

数目,基因,总数,培养基


?内蒙古农业大学硕士学位论文?11_??麦芽汁培养基??1400?:?5!差异基因总数?1注释到GO的数目?4注释到KEGG的数目??1200?g三??1000?g=?|=?H?二?{二?丨?|?=??<c?800?p?li?P?P?P養三謹至量巨??1?-?It?I?P?A?P?P?P?I?II??:il!llJlfcyll?ill??^?^?^?^?^?^??图3上调基因数目??Fig.?3?Number?of?up-regulated?differentially?expressed?genes??3.2.4下调基因数目统计??将条件为pH3.0的样品与其它pH条件下的样品进行差异表达分析,通过筛癣??统计得到下调基因的数目并将注释到GO、KEGG数据库中,数目统计结果如图4所??示,在Pach培养基中,下调的差异基因总数是12189个,在GO上注释到的功能数??12152个,在KEGG上注释到的途径共3521个。在麦芽汁培养基中,下调的差异基??因总数是8422个,在GO上注释到的功能数8402个,在KEGG上注释到的途径共??3149?个。??Pach培养基??2500?:?*差异基因总数=■注释到GO的数目注释到KEGG的数目??蠢?IS?I—?P?I?P?!?P?P??:I?Jy?11?Jy?11II??/?/■?/■?/■?/■?/??/■?/■??/?/?/?/?/?/?/?/?/??

数目,基因,培养基,基因表达


V2.?pH对酿酒酵母转录组的影响???麦芽汁培养基??1600?--?*差异基因总数?=■注释到GO的数目?I注释到KEGG的数目??1400?g二??1200?i|i?=??1000?_?i?三?S?二?匿巨?a-??=lliil?111??^?^?^?^?^?^?^??#?#?#?P?<s??4?#??f?f?f?穿?f?f?/_?f?/'??图4下调基因数目??Fig.4?Number?of?down-regulated?differentially?expressed?genes??3.3?pH对乙醛酸循环相关基因表达量的影响??3.3.1?pH对异柠檬酸裂解酶基因表达量的影响??300?50??幾?-??Pach培养基-*麦芽汁培养基??幺?45??250?40??I?200?35?|??S:?30?菡??m?1??f?150?25?I??室?*?*?4?20?£??S?l〇〇?A?*?1c;铢??^?*?4?15?M??50???4?4?10??修奐?I?5??〇?*???????0??2.0?3.0?4.0?5.0?6.0?7.0?8.0?9.0?10.0??培养基pH??图5不同初始pH条件下异柠檬酸裂解酶基因表达量??Fig.?5?The?ICL?gene?expression?in?different?pH?conditions??


本文编号:3101111

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