侧金盏的亲缘地理学研究

发布时间：2020-07-06 11:21

【摘要】：第四纪大冰期使全球气候发生巨大的变化,对现存物种的生长、演化、地理分布以及居群遗传结构产生了巨大的影响。近些年来,在推测现存物种在第四纪的冰期避难所位置方面,亲缘地理学(phylogeography)做出了杰出的贡献。对于我国亲缘地理学的探索主要针对于华南、华北和西南地区,然而,有关东北地区各类植物群体的冰期避难所研究就相对较少。为进一步探究东北地区各主要植物类群在冰期时的避难所及其间冰期的扩散路线,本研究以东北地区分布广泛的侧金盏(Adonis amurensis Regel et Radde)为实验对象,从而为研究该地区植物类群各居群间的演化过程提供理论基础,也为生物多样性的保护提供理论依据。本研究利用叶绿体DNA通用引物rps16R2-rps16F,对侧金盏进行了亲缘地理学研究,得到了单倍型网络图(haplotype network)、单倍型地理分布图(geographical distribution of haplotypes)和系统发育树(phylogenetic tree)。通过对选取的18个居群143个个体进行研究,测算出吉林东部地区各居群具有较高的遗传多样性,DH(Hd=0.7110,π=0.0012)、LSH(Hd=0.5710,π=0.0019)、JY(Hd=0.5360,π=0.0019)、JTJ(Hd=0.5330,π=0.0021),且共得到13种单倍型(haplotype)。通过对cp DNA进行AMOVA分析,结果显示侧金盏居群内的分化较明显。此外,结合侧金盏cp DNA的单倍型网络图和地理分布图,可将17个居群(除了外类群根河)分为3大组群——黑龙江东北及东南部、吉林东部(长白山北部)和辽宁东南部。从FST值可以看出,黑龙江东南及东北部居群和辽宁东南部居群的遗传距离(0.51156)最大。吉林东部居群单倍型较多且存在基出单倍型,这个地区可能是末次盛冰期时侧金盏的生物避难所,也是冰期后该物种重新扩散的起点。由此可初步推测,长白山北部可能是侧金盏在第四纪冰期时的避难所。这一结论与Qian的观点基本一致。
【学位授予单位】：东北师范大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：Q948.2
【图文】：

单倍型,测序,居群

图 3-1 基于 cpDNA 测序结果构建的单倍型图Fig. 3-1 The haplotype network of cpDNA of Adonis amurensis附注：“A—M”为单倍型的编号3.4 单倍型地理分布图分析将侧金盏单倍型网络图与中国东北地图相结合，得出侧金盏的单倍型地理分布图（图4-2）。从地理分布图上看，基出单倍型Hap D也是分布范围最广的，可称之为广布单倍型。其分布范围北到YL南到KD，也体现出Hap D是全部群体遗传构成的最主要单倍型。与Hap A相连的另一个Hap E在进化上也相对原始，为最基出单倍型，而这个单倍型仅存在长白山北部的JTJ中。此外，从侧金盏的地理分布图可以看出，各居群出现单倍型的数目具有一定的地域特点，LSH和JY两个居群各占有5种单倍型，DH占有4种单倍型，JTJ、HR和KD各占有2种单倍型，其他居群均只有1个单倍型。吉林东部的居群单倍型数目较多，而黑龙江东南、东北部和辽宁东南部的单倍型较为单一。位于单倍型网络图末端的Hap L仅分布于辽宁东南部地区，表明该区域的居群是后扩散的。Hap I和Hap H均是LSH的特有单倍型，并且与Hap D相连，表明该区域的居群在进化上较原

地理分布图,单倍型,毕业论文,硕士

东北师范大学硕士毕业论文22图3-2 侧金盏cpDNA的单倍型地理分布图Fig. 3-2 The geographical distribution of cpDNA haplotypes of Adonis amurensis

单倍型,居群,黑龙江,亲缘关系

Hap B和Hap C由Hap D逐步与扩散而来的，两者与Hap D的亲缘关系比较近，均是黑龙江东南、东北部居群的特有单倍型。图3-3 侧金盏cpDNA单倍型构建的NJ树Table 3-3 The phylogenetic tree based on cpDNA haplotypes of Adonis amurensis

【参考文献】