青藏高原青甘韭的多次多倍化及谱系地理学研究
发布时间:2020-12-25 00:00
青藏高原植物青甘韭这一二倍体-四倍体复合体被我们选用为模式植物来探讨其四倍体的单次或多次起源及其对第四纪冰期动荡气候的回应。我们对该物种分布区域内48个居群的306个个体(所有个体的倍性均已知)的五套叶绿体片段(包括accD-psaI, trnH-psbA, trnL-trnF, trnS-trnG四套基因间隔区和rpl16内含子区域)进行测序。测序所得的多态性位点共确定了32种单倍型,其中11种单倍型为二倍体所特有,13种单倍型为四倍体所特有,而另外8种单倍型则为二倍体和四倍体这两种核型所共享的单倍型。如上所述,这32种单倍型在不同核型中的分布结合NETWORK分析结果共同表明:青甘韭四倍体至少经历了八次独立的起源事件。叶绿体单倍型的分布格局在高原东部和西部之间存在着明显的差异:高原东部的大部分居群包含有多种单倍型,而高原西部地区的17个四倍体居群却只包含有一种单倍型,从而表明高原西部居群经历了一次近期的扩张事件。除此之外,我们发现该多倍体复合体还经历了一次较早时期的种群扩张事件,大约发生在5-150千年前,位于高原最大次冰期(800-170千年前)之后。另外,高原上四倍体居群的高频...
【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
肠、、,
较低支持率的情况相似(如 Avise2000)。系统树将这犯种单倍型分为A和B两支。相对于B支,A支是一个较大的分支,它占有32种单倍型中的27种单倍型,余下的5种单倍型构成了基部分支B(图3一3A)。然而,A支内单倍型间的系统发生关系中,除了其中5个包含有2一4种单倍型的亚支得到了中等强度的支持外,其余各单倍型间的系统关系都没有得到很好的解决。Network以及TCS支系图分析结果与系统发育分析结果相一致,并使得32种单倍型间的系统关系得到了较好的解决(图3一3B)。而进一步的星状收缩分析最终确定了4个聚类分支(I,11,111,IV;图3一3B)
图34青甘韭cpDNA单倍型分布图,细线圆圈代表二倍体居群,粗线圆圈代表四倍体居群。A,主要以及特有单倍型的分布图,彩色圆圈表示在一个以上居群中出现的单倍型,白色圆圈则表示只在一个居群中出现的单倍型(我们将之定义为特有单倍型,其中内部加小黑点者表示B支特有单倍型);B,四个单倍型聚类分支的分布图(依据图3一3B)Fig.34T七eg以犯不甲hicdis州bu石onofcPDNAh即】0勿pesobservedinA.户谈卿动枷”um.Thinlines田旧undc流lesindiG时ediPloidpoPu】西佃‘班司加记lines代presenttetraPtoids.A,
本文编号:2936553
【文章来源】:兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
肠、、,
较低支持率的情况相似(如 Avise2000)。系统树将这犯种单倍型分为A和B两支。相对于B支,A支是一个较大的分支,它占有32种单倍型中的27种单倍型,余下的5种单倍型构成了基部分支B(图3一3A)。然而,A支内单倍型间的系统发生关系中,除了其中5个包含有2一4种单倍型的亚支得到了中等强度的支持外,其余各单倍型间的系统关系都没有得到很好的解决。Network以及TCS支系图分析结果与系统发育分析结果相一致,并使得32种单倍型间的系统关系得到了较好的解决(图3一3B)。而进一步的星状收缩分析最终确定了4个聚类分支(I,11,111,IV;图3一3B)
图34青甘韭cpDNA单倍型分布图,细线圆圈代表二倍体居群,粗线圆圈代表四倍体居群。A,主要以及特有单倍型的分布图,彩色圆圈表示在一个以上居群中出现的单倍型,白色圆圈则表示只在一个居群中出现的单倍型(我们将之定义为特有单倍型,其中内部加小黑点者表示B支特有单倍型);B,四个单倍型聚类分支的分布图(依据图3一3B)Fig.34T七eg以犯不甲hicdis州bu石onofcPDNAh即】0勿pesobservedinA.户谈卿动枷”um.Thinlines田旧undc流lesindiG时ediPloidpoPu】西佃‘班司加记lines代presenttetraPtoids.A,
本文编号:2936553
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