热带雨林转变为橡胶林对土壤微生物的影响研究
发布时间:2021-06-29 21:51
热带雨林是陆地上物种多样性最为丰富的生态系统之一,近年由于橡胶树的种植,我国境内大规模的热带雨林被橡胶林所代替,引发一系列的生态问题。本文从不同植被类型下土壤微生物多样性和群落结构的变化角度出发,通过采集西双版纳地区10年、20年、30年橡胶林和低丘雨林以及沟谷雨林010cm、1020cm和2040cm各3层土壤样品,分析各个土壤样品的理化性质并基于Illumina MiSeq技术研究热带雨林转变为橡胶林之后土壤微生物多样性及其群落结构的变化。结果表明:热带雨林转变为橡胶林过程中地表植被变化对自然含水率、容重、总孔隙度、有效磷、全氮、速效钾、全钾以及pH都存在显著影响。热带雨林破坏后在种植橡胶林过程中土壤理化性质会随着种植年限的增长表现出巨大的差异性。植被类型变化后,各层土壤理化性质变化最大的为中层土壤,而微生物多样性指数变化最显著的也为中层土壤,表明热带雨林转化为橡胶林对中层土壤理化性质和微生物分布影响最为显著。土壤微生物丰度Ace和Chao指数显示20年橡胶林土壤微生物丰度最高,低丘雨林最低;土壤微生物多样性各个样地...
【文章来源】:云南师范大学云南省
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 引言
1.2 研究目的及意义
1.3 国内外研究进展
1.3.1 国外研究进展
1.3.2 国内研究进展
1.4 研究内容
1.5 技术路线
第2章 研究区概况
2.1 地理位置
2.2 气象条件
2.3 水文条件
2.4 土壤类型
2.5 植被分布
2.6 农林业生产
第3章 研究方法
3.1 土壤样品采集及保存
3.2 土壤理化性质测定
3.3 土壤微生物多样性测定
3.3.1 土壤基因组DNA提取
3.3.2 PCR扩增
3.3.3 荧光定量
3.3.4 土壤宏基因组克隆文库的构建及Miseq测序
3.4 测序数据分析
3.5 多样性指数计算
第4章 结果与分析
4.1 土壤理化性质
4.2 测序结果及多样性指数
4.2.1 OTU聚类
4.2.2 OTU分布文氏图
4.2.3 微生物多样性指数
4.3 微生物群落结构
4.3.1 微生物群落结构及组间差异
4.3.2 主成分分析
4.3.3 群落热图
4.4 微生物群落结构与环境因子
4.4.1 相关性分析
4.4.2 冗余分析
第5章 讨论
第6章 结论
参考文献
攻读学位期间发表的论文和研究成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]林麝粪便细菌多样性研究[J]. 周美丽,王立志,闫天海,杨营,徐琴,王继文,郭伟. 中国农业大学学报. 2016(02)
[2]紫茎泽兰入侵对土壤细菌的群落组成和多样性的影响[J]. 朱珣之,李强,李扬苹,韩洪波,马克平. 生物多样性. 2015(05)
[3]水葫芦栽培对池塘浮游细菌群落结构影响初探[J]. 范立民,陈家长,吴伟,孟顺龙,宋超,胡庚东,裘丽萍,瞿建宏,徐跑. 上海海洋大学学报. 2015(04)
[4]基于宏基因组分析四川泡菜母水作引子的泡菜发酵过程中细菌多样性变化[J]. 佟婷婷,田丰伟,王刚,刘小鸣,张灏,陈卫. 食品工业科技. 2015(21)
[5]荒漠区啮齿动物群落与植物因子的冗余分析[J]. 乌云嘎,查木哈,张晓东,袁帅,付和平,武晓东,甘红军. 草业科学. 2014(12)
[6]西双版纳橡胶林面积遥感监测和时空变化[J]. 廖谌婳,李鹏,封志明,张景华. 农业工程学报. 2014(22)
[7]基于面向对象的西双版纳橡胶林提取[J]. 李怀霄. 江西农业学报. 2014(08)
[8]Illumina MiSeq平台高覆盖率测定干酪中的细菌微生物多样性[J]. 焦晶凯,莫蓓红. 中国酿造. 2014(05)
[9]长期施肥对红壤旱地玉米生物量及养分吸收的影响[J]. 颜雄,彭新华,张杨珠,周虎,余喜初,王雪芬,谢平. 水土保持学报. 2013(02)
[10]橡胶园土壤全氮和速效钾养分合理取样位置研究[J]. 林清火,郭澎涛,罗微,林钊沐,张培松. 热带作物学报. 2013(02)
博士论文
[1]典型海域微生物群落结构及其生物地球化学意义[D]. 刘吉文.中国海洋大学 2014
[2]1,3-D防治蔬菜根结线虫病及其对土壤细菌多样性的影响[D]. 乔康.山东农业大学 2013
[3]三江源国家自然保护区土壤微生物的分子多样性研究[D]. 张于光.湖南农业大学 2005
硕士论文
[1]戴云山不同森林类型土壤微生物群落多样性特征的研究[D]. 陈志芳.福建农林大学 2014
[2]印度洋表层海水石油降解菌及其烷烃羟化酶AlkB的多样性分析[D]. 刘阳.华中农业大学 2013
[3]水环境中三种病毒PMA-PCR方法建立与基于焦磷酸测序技术的细菌多样性研究[D]. 韦玉梅.北京林业大学 2013
[4]MABR微生物群落结构的研究[D]. 张宏玉.天津大学 2012
[5]西双版纳热带雨林土壤微生物群落结构多样性及其木质素降解酶相关基因资源的宏基因组学研究[D]. 王春香.福建师范大学 2010
[6]黑麦草种植对烟田土壤微生物群落结构的影响[D]. 滕少娜.西南大学 2010
[7]连作和轮作棉田土壤微生物多样性分析及PGPR菌株筛选[D]. 张静文.新疆农业大学 2009
[8]黄海西北部真细菌群落结构及多样性研究[D]. 李海艳.中国海洋大学 2009
[9]西双版纳橡胶林的碳储量及其分配格局[D]. 庞家平.中国科学院研究生院(西双版纳热带植物园) 2009
[10]烟草秸秆覆盖下毛竹土壤微生物的变化规律[D]. 张文娟.福建农林大学 2008
本文编号:3257229
【文章来源】:云南师范大学云南省
【文章页数】:65 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 引言
1.2 研究目的及意义
1.3 国内外研究进展
1.3.1 国外研究进展
1.3.2 国内研究进展
1.4 研究内容
1.5 技术路线
第2章 研究区概况
2.1 地理位置
2.2 气象条件
2.3 水文条件
2.4 土壤类型
2.5 植被分布
2.6 农林业生产
第3章 研究方法
3.1 土壤样品采集及保存
3.2 土壤理化性质测定
3.3 土壤微生物多样性测定
3.3.1 土壤基因组DNA提取
3.3.2 PCR扩增
3.3.3 荧光定量
3.3.4 土壤宏基因组克隆文库的构建及Miseq测序
3.4 测序数据分析
3.5 多样性指数计算
第4章 结果与分析
4.1 土壤理化性质
4.2 测序结果及多样性指数
4.2.1 OTU聚类
4.2.2 OTU分布文氏图
4.2.3 微生物多样性指数
4.3 微生物群落结构
4.3.1 微生物群落结构及组间差异
4.3.2 主成分分析
4.3.3 群落热图
4.4 微生物群落结构与环境因子
4.4.1 相关性分析
4.4.2 冗余分析
第5章 讨论
第6章 结论
参考文献
攻读学位期间发表的论文和研究成果
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]林麝粪便细菌多样性研究[J]. 周美丽,王立志,闫天海,杨营,徐琴,王继文,郭伟. 中国农业大学学报. 2016(02)
[2]紫茎泽兰入侵对土壤细菌的群落组成和多样性的影响[J]. 朱珣之,李强,李扬苹,韩洪波,马克平. 生物多样性. 2015(05)
[3]水葫芦栽培对池塘浮游细菌群落结构影响初探[J]. 范立民,陈家长,吴伟,孟顺龙,宋超,胡庚东,裘丽萍,瞿建宏,徐跑. 上海海洋大学学报. 2015(04)
[4]基于宏基因组分析四川泡菜母水作引子的泡菜发酵过程中细菌多样性变化[J]. 佟婷婷,田丰伟,王刚,刘小鸣,张灏,陈卫. 食品工业科技. 2015(21)
[5]荒漠区啮齿动物群落与植物因子的冗余分析[J]. 乌云嘎,查木哈,张晓东,袁帅,付和平,武晓东,甘红军. 草业科学. 2014(12)
[6]西双版纳橡胶林面积遥感监测和时空变化[J]. 廖谌婳,李鹏,封志明,张景华. 农业工程学报. 2014(22)
[7]基于面向对象的西双版纳橡胶林提取[J]. 李怀霄. 江西农业学报. 2014(08)
[8]Illumina MiSeq平台高覆盖率测定干酪中的细菌微生物多样性[J]. 焦晶凯,莫蓓红. 中国酿造. 2014(05)
[9]长期施肥对红壤旱地玉米生物量及养分吸收的影响[J]. 颜雄,彭新华,张杨珠,周虎,余喜初,王雪芬,谢平. 水土保持学报. 2013(02)
[10]橡胶园土壤全氮和速效钾养分合理取样位置研究[J]. 林清火,郭澎涛,罗微,林钊沐,张培松. 热带作物学报. 2013(02)
博士论文
[1]典型海域微生物群落结构及其生物地球化学意义[D]. 刘吉文.中国海洋大学 2014
[2]1,3-D防治蔬菜根结线虫病及其对土壤细菌多样性的影响[D]. 乔康.山东农业大学 2013
[3]三江源国家自然保护区土壤微生物的分子多样性研究[D]. 张于光.湖南农业大学 2005
硕士论文
[1]戴云山不同森林类型土壤微生物群落多样性特征的研究[D]. 陈志芳.福建农林大学 2014
[2]印度洋表层海水石油降解菌及其烷烃羟化酶AlkB的多样性分析[D]. 刘阳.华中农业大学 2013
[3]水环境中三种病毒PMA-PCR方法建立与基于焦磷酸测序技术的细菌多样性研究[D]. 韦玉梅.北京林业大学 2013
[4]MABR微生物群落结构的研究[D]. 张宏玉.天津大学 2012
[5]西双版纳热带雨林土壤微生物群落结构多样性及其木质素降解酶相关基因资源的宏基因组学研究[D]. 王春香.福建师范大学 2010
[6]黑麦草种植对烟田土壤微生物群落结构的影响[D]. 滕少娜.西南大学 2010
[7]连作和轮作棉田土壤微生物多样性分析及PGPR菌株筛选[D]. 张静文.新疆农业大学 2009
[8]黄海西北部真细菌群落结构及多样性研究[D]. 李海艳.中国海洋大学 2009
[9]西双版纳橡胶林的碳储量及其分配格局[D]. 庞家平.中国科学院研究生院(西双版纳热带植物园) 2009
[10]烟草秸秆覆盖下毛竹土壤微生物的变化规律[D]. 张文娟.福建农林大学 2008
本文编号:3257229
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