中国东北梅花鹿种群遗传多样性初步研究
发布时间：2021-08-10 19:54
梅花鹿（Cervus nippon）为国家Ⅰ级重点保护野生动物,分化为6个亚种：东北亚种（C.n.hortulorum）、华北亚种（C.n. mandurinui）、华南亚种（C.n.korpscni）、四川亚种（C.n.sichunicus）、山西亚种（C. n.grassianus）、台湾亚种（C.n.taiouanus）,其中山西亚种、华北亚种和台湾亚种野外种群已经灭绝,野外残存的东北亚种、华南亚种和四川亚种仅分布于黑龙江、吉林、江西、浙江、安徽、四川和甘肃等省破碎的栖息生境内。由于残存的3个亚种种群数量稀少,野外很难发现,这对保护和恢复濒临灭绝的野生梅花鹿种群造成一定的困难。本文利用线粒体细胞色素6鉴定在中国东北地区采集的疑似野生梅花鹿样品是否属于梅花鹿,利用线粒体控制区比较野生东北梅花鹿遗传多样性与其他亚种的差异性,利用微卫星标记综合评价东北地区野生梅花鹿种群、圈养梅花鹿种群、散放梅花鹿种群遗传多样性现状,得到结果如下：1.通过Blast比对线粒体细胞色素6序列确定粪便样品的来源物种,确定52份疑似野生梅花鹿粪便样品中属于梅花鹿样品18份,其他样品均是狍子粪便样品。2.采用1...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：52 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 梅花鹿概述
1.1.1 梅花鹿的分类地位和分布
1.1.2 梅花鹿保护遗传学研究现状
1.1.3 种群主要威胁因素
1.2 线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)
1.2.1 线粒体细胞色素b
1.2.2 线粒体控制区
1.3 微卫星DNA(Microsatellites DNA)
1.3.1 微卫星DNA的特点
1.3.2 微卫星DNA的应用
1.4 研究目的和意义
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 实验样品
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要实验仪器设备
2.2 实验方法
2.2.1 DNA提取
2.2.2 线粒体细胞色素b序列分析
2.2.3 线粒体控制区全序列分析
2.2.4 微卫星分析
3 实验结果
3.1 粪便和肌肉DNA提取及引物扩增
3.2 鉴定野生梅花鹿样品
3.3 个体识别
3.3.1 圈养梅花鹿个体识别
3.3.2 野生梅花鹿和圈养梅花鹿个体识别
3.4 遗传多样性
3.4.1 野生梅花鹿线粒体控制区检测结果
3.4.2 梅花鹿微卫星检测结果
4 讨论
4.1 取样和总DNA提取
4.2 引物筛选
4.3 微卫星引物的有效性评价
4.4 东北地区野生梅花鹿分布
4.5 东北地区梅花鹿遗传多样性评价
4.5.1 梅花鹿线粒体遗传多样性评价
4.5.2 梅花鹿微卫星遗传多样性评价
4.5.3 哈温平衡和连锁不平衡
4.6 加强野生梅花鹿的保护力度
4.7 保护愿景展望
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]东北梅花鹿线粒体COⅡ基因序列的遗传结构及其系统发育分析[J]. 徐佳萍,荣敏,杨福合,邢秀梅. 特产研究. 2011(04)
[2]应用mtDNA Cytb基因全序列分析中国5个马鹿群体的遗传多样性和系统发育[J]. 张丽,滚双宝,雷天云,刘丽霞,秦大伟,赵世峰. 华北农学报. 2010(04)
[3]吉林梅花鹿IGF-I基因启动子区单核苷酸多态性分析[J]. 李赵志,严昌国,张立春,曹阳,金海国. 安徽农业科学. 2010(13)
[4]梅花鹿3个种群遗传多样性的微卫星标记分析[J]. 孙海涛,李馨,耿忠诚,杨隽,刘文峰,王忠武,黄淑元. 动物学杂志. 2009(03)
[5]梅花鹿的微卫星多态性及种群的遗传结构[J]. 吴华,胡杰,万秋红,方盛国,刘武华,章叔岩. 兽类学报. 2008(02)
[6]勐养保护区亚洲象微卫星位点筛选及种群遗传多样性分析[J]. 蔡清秀,林柳,潘文婧,罗述金,张立. 兽类学报. 2008(02)
[7]韩国与中国东北地区松鼠线粒体DNA控制区的序列变异（英文）[J]. KOH Hung Sun,张明海,王金星,SHIN Dong Sun,LEEBaeGeun. 兽类学报. 2006(01)
[8]从Cyt b基因全序列分析中国10个黄牛品种的系统进化关系[J]. 蔡欣,陈宏,雷初朝,王珊,张志清,薛恺,王新庄. 中国生物化学与分子生物学报. 2006(02)
[9]中国梅花鹿（Cervus nippon）遗传多样性及与日本梅花鹿间的系统关系[J]. 吕晓平,魏辅文,李明,杨光,刘海. 科学通报. 2006(03)
[10]川金丝猴群体的微卫星多态性研究[J]. 潘登,李英,胡鸿兴,蒙世杰,门正明,符云新,张亚平. 科学通报. 2005(22)
博士论文
[1]梅花鹿保护遗传学研究[D]. 吴华.浙江大学 2004
[2]虎（Panthera tigris）微卫星位点多态性及其在圈养种群管理中的应用[D]. 徐艳春.东北林业大学 2001
硕士论文
[1]长春双阳梅花鹿群体遗传结构的研究与分析[D]. 牛伟萍.吉林大学 2011
本文编号：3334683
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：52 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 绪论
1.1 梅花鹿概述
1.1.1 梅花鹿的分类地位和分布
1.1.2 梅花鹿保护遗传学研究现状
1.1.3 种群主要威胁因素
1.2 线粒体DNA(Mitochondrial DNA,mtDNA)
1.2.1 线粒体细胞色素b
1.2.2 线粒体控制区
1.3 微卫星DNA(Microsatellites DNA)
1.3.1 微卫星DNA的特点
1.3.2 微卫星DNA的应用
1.4 研究目的和意义
2 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 实验样品
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要实验仪器设备
2.2 实验方法
2.2.1 DNA提取
2.2.2 线粒体细胞色素b序列分析
2.2.3 线粒体控制区全序列分析
2.2.4 微卫星分析
3 实验结果
3.1 粪便和肌肉DNA提取及引物扩增
3.2 鉴定野生梅花鹿样品
3.3 个体识别
3.3.1 圈养梅花鹿个体识别
3.3.2 野生梅花鹿和圈养梅花鹿个体识别
3.4 遗传多样性
3.4.1 野生梅花鹿线粒体控制区检测结果
3.4.2 梅花鹿微卫星检测结果
4 讨论
4.1 取样和总DNA提取
4.2 引物筛选
4.3 微卫星引物的有效性评价
4.4 东北地区野生梅花鹿分布
4.5 东北地区梅花鹿遗传多样性评价
4.5.1 梅花鹿线粒体遗传多样性评价
4.5.2 梅花鹿微卫星遗传多样性评价
4.5.3 哈温平衡和连锁不平衡
4.6 加强野生梅花鹿的保护力度
4.7 保护愿景展望
结论
参考文献
攻读学位期间发表的学术论文
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]东北梅花鹿线粒体COⅡ基因序列的遗传结构及其系统发育分析[J]. 徐佳萍,荣敏,杨福合,邢秀梅. 特产研究. 2011(04)
[2]应用mtDNA Cytb基因全序列分析中国5个马鹿群体的遗传多样性和系统发育[J]. 张丽,滚双宝,雷天云,刘丽霞,秦大伟,赵世峰. 华北农学报. 2010(04)
[3]吉林梅花鹿IGF-I基因启动子区单核苷酸多态性分析[J]. 李赵志,严昌国,张立春,曹阳,金海国. 安徽农业科学. 2010(13)
[4]梅花鹿3个种群遗传多样性的微卫星标记分析[J]. 孙海涛,李馨,耿忠诚,杨隽,刘文峰,王忠武,黄淑元. 动物学杂志. 2009(03)
[5]梅花鹿的微卫星多态性及种群的遗传结构[J]. 吴华,胡杰,万秋红,方盛国,刘武华,章叔岩. 兽类学报. 2008(02)
[6]勐养保护区亚洲象微卫星位点筛选及种群遗传多样性分析[J]. 蔡清秀,林柳,潘文婧,罗述金,张立. 兽类学报. 2008(02)
[7]韩国与中国东北地区松鼠线粒体DNA控制区的序列变异（英文）[J]. KOH Hung Sun,张明海,王金星,SHIN Dong Sun,LEEBaeGeun. 兽类学报. 2006(01)
[8]从Cyt b基因全序列分析中国10个黄牛品种的系统进化关系[J]. 蔡欣,陈宏,雷初朝,王珊,张志清,薛恺,王新庄. 中国生物化学与分子生物学报. 2006(02)
[9]中国梅花鹿（Cervus nippon）遗传多样性及与日本梅花鹿间的系统关系[J]. 吕晓平,魏辅文,李明,杨光,刘海. 科学通报. 2006(03)
[10]川金丝猴群体的微卫星多态性研究[J]. 潘登,李英,胡鸿兴,蒙世杰,门正明,符云新,张亚平. 科学通报. 2005(22)
博士论文
[1]梅花鹿保护遗传学研究[D]. 吴华.浙江大学 2004
[2]虎（Panthera tigris）微卫星位点多态性及其在圈养种群管理中的应用[D]. 徐艳春.东北林业大学 2001
硕士论文
[1]长春双阳梅花鹿群体遗传结构的研究与分析[D]. 牛伟萍.吉林大学 2011
本文编号：3334683
本文链接：https://www.wllwen.com/projectlw/zrdllw/3334683.html
