中国北方汉族人群FUT6基因3个SNPs遗传多态性
本文关键词:中国北方汉族人群FUT6基因3个SNPs遗传多态性
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【摘要】:目的对中国北方汉族人群FUT6基因编码区序列特征及等位基因多态性进行调查。方法测序分析30例中国北方汉族人FUT6基因整个编码区序列并鉴定其单倍型,采用复合PCR与复合限制性内切酶结合的RFLP法分析FUT6基因rs778805(C370T)、G855A及rs61147939(C907G)3个SNPs遗传多态性;应用Haploview4.1软件进行相关统计分析。结果 30例测序样本中共检出8个SNPs和6种单倍型,149例中国北方汉族个体C370T、G855A、C907G基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡。杂合度分别为0.544、0.416、0.510;多态信息含量为0.375、0.372、0.367;个人识别能力为0.600、0.651、0.603;非父排除率为0.187、0.186、0.183。PCR-RFLPs检出13种基因型,单倍型变异度为0.646。Haploview4.1软件分析表明3个SNPs处于连锁不平衡状态。结论中国北方汉族人群FUT6基因编码区序列呈现出高度多态性;C370T、G855A、C907G位点多态性分布良好,但处于连锁不平衡状态。
【作者单位】: 中国医科大学法医学院;包头医学院法医学系;
【关键词】: 法医物证学 遗传多态性 复合聚合酶链反应 复合限制性酶切反应 岩藻糖基转移酶基因Ⅵ
【基金】:辽宁省自然科学基金(20082109) 辽宁省教育厅2008度高等学校科研项目计划(2008837)
【分类号】:D919.1
【正文快照】: 人类岩藻糖基转移酶Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ(FUT3、FUT5、FUT6)定位于19p13.3长约40kb的区域内,由于3个基因的碱基序列具有高达85%~90%的同源性,被认为源于同一始祖基因。FUT6基因编码区序列长1080bp,由其编码的360个氨基酸的产物催化岩藻糖基转移到细胞表面糖脂类和糖蛋白的G lcNAc残基
【共引文献】
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