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应用细胞色素氧化酶亚基I鉴定蝇科常见嗜尸性蝇种

发布时间:2017-08-23 18:28

  本文关键词:应用细胞色素氧化酶亚基I鉴定蝇科常见嗜尸性蝇种


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【摘要】:背景: 法医昆虫学(Forensic entomology)是法医学和节肢动物科学在广泛领域结合并相互影响的一门新型交叉边缘性学科,应用范围上涉及刑事、民事、行政案件,为法医实际检案提供技术帮助。主要研究方法是对在尸体内、尸体表面或尸体附近采集到的昆虫标本,进行检验、鉴定、分类后,明确昆虫种类或确定某一昆虫生长发育状态,结合该昆虫在尸体上的生态群落演替及生活习性,帮助法医完成死亡时间(postmortem interval, PMI)推断。在应用尸体上昆虫群落演替规律解决相关法医学问题的前提是鉴定昆虫的种类。 机体死后不久,就会有大量嗜尸性蝇类到达并产卵,因此,测定尸体上嗜尸性蝇类的种类及其蛹的发育龄期是估计死亡时间(PMI)的重要昆虫学资料。然而昆虫种类繁多,只有经过专门训练的专业人员才能掌握某类群的形态学鉴别要点。利用形态学特征鉴定蝇类的方法不能得到很好的普及,也给法医工作者日常实际检案带来很大障碍。 近年发展起来的分子生物学技术便很好的解决了这一难题,本研究通过运用自行设计的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(co Ⅰ)引物,从基因水平探索昆虫种类的鉴别。使昆虫种类鉴定方法更为准确和科学。 目的: 应用272bp的细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(co Ⅰ)的基因片段对蝇科常见嗜尸性蝇种进行种类鉴定,为建立地区嗜尸性昆虫基因库积累数据,为蝇科嗜尸性蝇种在实践中进行死亡时间推断奠定基础。 方法: 2009-2011年在湖南省及周边省份应用家兔尸体诱捕嗜尸性蝇科成虫,与本教研室前期(2007-2008)捕获的嗜尸性蝇科样本进行汇总、挑选,邀请湖南省农业大学昆虫学专家对挑选出的样本进行形态学鉴定。利用十六烷基三甲溴化铵(CTAB)法提取样本DNA,琼脂糖凝胶电泳检测提取效果。Epoendorf梯度PCR仪进行扩增,PCR胶回收试剂盒纯化。纯化产物送往华大基因(武汉)进行序列测性;MEGA4软件包进行序列分析及构建系统发育树。 结果: 通过对DNA COI片段进行PCR扩增和测序的方法,能有效检测出嗜尸性蝇科样本的基因序列,利用MEGA4.0软件构建系统发育树。得出与形态学鉴定一致的种类,鉴定出4属5种蝇类的种属关系:家蝇属中家蝇;黑蝇属中厚环黑蝇、斑踱黑蝇;腐蝇属中厩腐蝇;螫蝇属中厩螫蝇。 结论: DNA序列分析具有快速、简便和精确的特点,是目前分析进化及系统发育研究中有效、可靠的方法,分子鉴定是对形态学鉴定方法上的一个有效补充,因此,mtDNA的272bp COI片段是鉴定蝇科常见嗜尸性蝇种的一个有效分子标记。
【关键词】:法医昆虫学 死亡时间推断 线粒体DNA 细胞色素氧化酶亚基I 种属鉴定
【学位授予单位】:中南大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:D919.1
【目录】:
  • 摘要4-6
  • ABSTRACT6-11
  • 技术路线11-12
  • ~.略词表12-13
  • 前言13-15
  • 第一章 材料与方法15-24
  • 1.1 主要实验试剂和仪器15-17
  • 1.1.1 主要实验试剂15
  • 1.1.2 主要试剂配制15-17
  • 1.1.3 主要仪器17
  • 1.2 样本来源和处理17-20
  • 1.3 实验方法与步骤20-24
  • 1.3.1 DNA提取20-21
  • 1.3.2 DNA质量浓度和纯度检测21
  • 1.3.3 琼脂糖电泳检测DNA提取效果21
  • 1.3.4 PCR引物设计及PCR扩增21-23
  • 1.3.5 PCR扩增产物纯化及测序23
  • 1.3.6 序列分析和系统发育树的构建23-24
  • 第二章 结果24-38
  • 2.1 形态学鉴定结果24-26
  • 2.2 琼脂糖电泳检测mtDNA提取效果26-27
  • 2.3 COI DNA基因测序结果27-32
  • 2.4 种蝇科序列登录NCBI数据库搜索结果32
  • 2.5 COI序列分析和系统发育树构建结果32-35
  • 2.6 通过COIDNA基因序列获得的遗传距离35-38
  • 2.6.1 种间差异35-36
  • 2.6.2 种内差异36-37
  • 2.6.3 两两种类种间差异百分比37-38
  • 第三章 讨论38-40
  • 第四章 结论40-41
  • 参考文献41-45
  • 综述45-51
  • 参考文献48-51
  • 致谢51-52
  • 攻读硕士学位期间的研究成果52

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前6条

1 张亚平,施立明;动物线粒体DNA多态性的研究概况[J];动物学研究;1992年03期

2 蔡继峰,常云峰,廖志钢,刘敏,董建国,陶涛,潘洪富,张林,闫红涛;嗜尸性苍蝇mtDNA中COⅡ基因序列检测[J];中国法医学杂志;2005年04期

3 孙晓明;蔡继峰;应斌武;方月琴;云利兵;袁万安;高山;侯一平;;16SrDNA序列分析在嗜尸性蝇类鉴定中的应用[J];法医学杂志;2006年01期

4 李响;蔡继峰;;mtDNA多态性在嗜尸性昆虫种类鉴定中的应用[J];法医学杂志;2011年02期

5 陈瑶清;郭亚东;李茂枝;熊枫;李剑波;蔡继峰;;常见嗜尸性昆虫mtDNA提取方法的比较[J];法医学杂志;2011年04期

6 李涛,赖旭龙,钟扬;利用DNA序列构建系统树的方法[J];遗传;2004年02期



本文编号:726598

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