基于Pseudomonas sp. T13强化的好氧反硝化系统构建及脱氮效能研究
【学位授予单位】:哈尔滨工业大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:X703
【图文】:
napA 16S图2-3 PCR凝胶电泳图Figure 2-3 PCR gel electrophoresis实时荧光定量PCR仪(ABI 7500 FAST,美表2-18 PCR反应混合液Table 2-18 Mixture of PCR reaction试剂(浓度) 用量μLDNA模板 0.5dNTP (10 mmol/L) 0.5Taq Buffer (10×) 2.5MgCl2(25 mmol/L) 2Taq Polymerase 0.2PCR-grade pure H2O 18.3Primer F (10 μmol/L) 0.5Primer R (10 μmol/L) 0.5
第 2 章 实验材料与方法DOTUR和Phylip等软件计算矩阵距离并由此进行聚类分析,根据97%相似性划分分类操作单元 (operational taxonomic units,OTU),获得rarefaction 曲线,计算评估丰度评价指数(Chao1)和多样性指数(Shannon)[129];再利用RDP na veBayesian rRNA classifier和Greengenes classify在线分类,结合BLAST比对确定所测的序列分类地位。所获得高通量测序原始数据上传并公开于NCBI网络公开数据库(Short Read Archive (SRA) database),获取数据查阅登录号PRJNA310145。2.2.6.4 菌群网络构建及分析(Cytoscape network)基于Illumina 高通量测序获得的OTUs数据,采用Cytoscape 3.2.1进行网络构建[121]。相关操作如图2-5所示。
0201 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22菌株编号00.2去图 3-3 分离获得 22株脱氮菌对总氮和硝氮去除能力比较Figure 3-3 Comparision of TN and NO3- N removal by 22 strains3.2.3 好氧反硝化菌多相分类鉴定3.2.3.1 好氧反硝化菌的形态特征通过平板划线法选取单菌落,得到形态特征相同、均匀分布的细菌单克隆培养物,并进行革兰氏染色,如图 3-4。根据《伯杰氏细菌手册》首先观察微生物群体形态。在固体培养基中培养 24 h 后,观察发现菌株 T13的单菌落为圆形、不透明的淡黄色,直径大小在 1.5-3.5 mm 之间,菌落边缘不太规则,表面为凸起的褶皱,菌间具有一定粘性,具体菌落形态结果见表 3-1。对菌株进行革兰氏染色显示为红色,则该菌为革兰氏阴性菌。
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本文编号:2791240
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