长江口滨岸水环境中抗生素抗性基因的赋存特征
发布时间:2021-03-24 20:43
抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)作为一种新型的环境污染物,因其可被细菌吸收而影响人类健康和生态环境安全,已经成为全球热点环境问题之一。河口及近海岸区域是海洋与河流或陆地交汇的重要过渡区域,因其特殊的地理位置和重要的生态价值,一直以来是环境地学研究的重点。该区域往往水体环境条件复杂、潮汐作用强烈、环境介质多样,且受人类活动的影响,接纳包括ARGs在内的大量环境污染物质,那么在这个较为复杂的生态系统中,ARGs的来源、分布、含量、迁移及其环境影响因素如何,尚待研究。本文以长江口及其邻近水域为研究对象,重点选择滨岸水环境中的微生物被膜、沉积物和表层水为研究介质,通过PCR(polymerase chain reaction)和qPCR(quantitative-polymerase chain reaction)技术分别定性和定量三种介质中ARGs及其相关基因的种类和丰度;利用UPLC-MS-MS和SP-ICP-MS等技术分别测定环境介质中抗生素和重金属含量;使用Illumina Miseq高通量测序平台和LB琼脂平板培养法等技术分析环境中微...
【文章来源】:华东师范大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:180 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
细菌获取抗生素抗性的途径(AlekshunandLevy,2007)
华东师范大学 2019 届博士学位论文 第一章 绪论个抗生素抗性基因(Luo et al., 2017)。Yang 等(2019)下载并分析数据库中已有的宏基因组数据,通过与抗生素抗性基因数据比对,发现了海洋环境中塑料表面微生物群落中存在抗 13 种抗生素共 64 个抗生素抗性基因亚型,而对应的海水环境中有 6 个抗生素抗性基因亚型。综上所述,无论是单一微生物培养技术、PCR 定性、qPCR 定量还是宏基因组学均能在一定程度上被用于环境中抗生素抗性基因的研究。因此,在以后的研究中,可以根据科学问题导向和实验目的的需求选择适合的方法。
2 材料与方法2.1 样本的采集与存储长江口滨岸水体环境中微生物被膜、沉积物和表层水采自于 2016 年 10体采样点分布如图 2-1 所示。自西向东分别是浒浦(XP:31°45′491°56′11″E)、七浦河河口(QYK:31°36′33″N, 121°14′21″E)、浏河河口(LH°31′4″N, 121°17′56″E)、石洞口(SDK:31°28′41″N, 121°23′49″E)、吴淞口(W°23′28″N, 121°30′39″E)、三叉口(SCK:31°14′32″N, 121°45′26″E)和朝阳农Y:31°4′26″N, 121°53′30″E)。其中,浒浦是一个潮滩环境;七丫口是七浦河江交汇的环境;浏河口是浏河与长江交汇的环境;吴淞口是黄浦江和长江交较为复杂的环境;石洞口是一个城市污水处理厂排污河道与长江交汇环境口同样是一个潮滩环境;朝阳农场也是一个潮滩环境。
【参考文献】:
期刊论文
[1]纳米颗粒物:独具特性的地球化学组成[J]. 杨毅,周立旻,钭斐昀,孙笑丽,刘敏,Michael F.Hochella Jr.. 地球科学. 2018(05)
[2]不同活性污泥中菌群多样性及差异分析[J]. 闫来洪,张振冲,郗丽君,梁文龙. 化学与生物工程. 2016(08)
[3]环境抗生素抗性基因研究进展[J]. 苏建强,黄福义,朱永官. 生物多样性. 2013(04)
[4]底泥水体中适用于PCR的不同形态DNA的提取方法[J]. 冯凌,罗义. 生态毒理学报. 2010(02)
[5]抗生素抗性基因在环境中的来源、传播扩散及生态风险[J]. 徐冰洁,罗义,周启星,毛大庆. 环境化学. 2010(02)
[6]长江口及其邻近海域沉积物重金属分布特征和环境质量评价[J]. 盛菊江,范德江,杨东方,齐红艳,徐琳. 环境科学. 2008(09)
[7]长江口内外表层沉积物中营养元素的分布特征研究[J]. 吕晓霞,翟世奎,于增慧,张怀静. 海洋通报. 2005(02)
博士论文
[1]长江口滨岸水中胶体对新型有机污染物环境行为的影响研究[D]. 晏彩霞.华东师范大学 2015
硕士论文
[1]河口水环境中纳米氧化锌对微生物的生态风险及其机制研究[D]. 封竞男.华东师范大学 2018
本文编号:3098362
【文章来源】:华东师范大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:180 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
细菌获取抗生素抗性的途径(AlekshunandLevy,2007)
华东师范大学 2019 届博士学位论文 第一章 绪论个抗生素抗性基因(Luo et al., 2017)。Yang 等(2019)下载并分析数据库中已有的宏基因组数据,通过与抗生素抗性基因数据比对,发现了海洋环境中塑料表面微生物群落中存在抗 13 种抗生素共 64 个抗生素抗性基因亚型,而对应的海水环境中有 6 个抗生素抗性基因亚型。综上所述,无论是单一微生物培养技术、PCR 定性、qPCR 定量还是宏基因组学均能在一定程度上被用于环境中抗生素抗性基因的研究。因此,在以后的研究中,可以根据科学问题导向和实验目的的需求选择适合的方法。
2 材料与方法2.1 样本的采集与存储长江口滨岸水体环境中微生物被膜、沉积物和表层水采自于 2016 年 10体采样点分布如图 2-1 所示。自西向东分别是浒浦(XP:31°45′491°56′11″E)、七浦河河口(QYK:31°36′33″N, 121°14′21″E)、浏河河口(LH°31′4″N, 121°17′56″E)、石洞口(SDK:31°28′41″N, 121°23′49″E)、吴淞口(W°23′28″N, 121°30′39″E)、三叉口(SCK:31°14′32″N, 121°45′26″E)和朝阳农Y:31°4′26″N, 121°53′30″E)。其中,浒浦是一个潮滩环境;七丫口是七浦河江交汇的环境;浏河口是浏河与长江交汇的环境;吴淞口是黄浦江和长江交较为复杂的环境;石洞口是一个城市污水处理厂排污河道与长江交汇环境口同样是一个潮滩环境;朝阳农场也是一个潮滩环境。
【参考文献】:
期刊论文
[1]纳米颗粒物:独具特性的地球化学组成[J]. 杨毅,周立旻,钭斐昀,孙笑丽,刘敏,Michael F.Hochella Jr.. 地球科学. 2018(05)
[2]不同活性污泥中菌群多样性及差异分析[J]. 闫来洪,张振冲,郗丽君,梁文龙. 化学与生物工程. 2016(08)
[3]环境抗生素抗性基因研究进展[J]. 苏建强,黄福义,朱永官. 生物多样性. 2013(04)
[4]底泥水体中适用于PCR的不同形态DNA的提取方法[J]. 冯凌,罗义. 生态毒理学报. 2010(02)
[5]抗生素抗性基因在环境中的来源、传播扩散及生态风险[J]. 徐冰洁,罗义,周启星,毛大庆. 环境化学. 2010(02)
[6]长江口及其邻近海域沉积物重金属分布特征和环境质量评价[J]. 盛菊江,范德江,杨东方,齐红艳,徐琳. 环境科学. 2008(09)
[7]长江口内外表层沉积物中营养元素的分布特征研究[J]. 吕晓霞,翟世奎,于增慧,张怀静. 海洋通报. 2005(02)
博士论文
[1]长江口滨岸水中胶体对新型有机污染物环境行为的影响研究[D]. 晏彩霞.华东师范大学 2015
硕士论文
[1]河口水环境中纳米氧化锌对微生物的生态风险及其机制研究[D]. 封竞男.华东师范大学 2018
本文编号:3098362
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