特异性定点共价固定化及酰基肽释放酶ST0779的非特异性催化的研究
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《吉林大学》 2015年
特异性定点共价固定化及酰基肽释放酶ST0779的非特异性催化的研究
李蓉
【摘要】:酶作为高效的生物催化剂在化工、食品、医药、环境治理和检测等领域得到了广泛的应用。但是酶制剂存在着活性不稳定、回收利用率差,容易受到外界因素如温度、pH值等的影响而失活等问题而使其应用受到了许多限制。酶固定化技术可以克服酶制剂在应用中稳定性差、重复利用率低等问题,因此越来越受到重视。 目前酶的固定化方法可分为非特异性固定化和特异性固定化。其中特异性固定化是通过对酶进行合理的设计和改造向酶蛋白中引进一些特殊的功能团,利用这些功能团可以使酶与载体进行特异性定点结合。此方法因可以针对性地提高酶活性、稳定性或增强催化特异性而成为当前的研究热点。 本文采用特异性定点共价固定化方法进行研究。通过对酶进行合理的设计和改造,向酶蛋白中引入特异性反应功能团——醛基,并利用此功能团定点与氨基载体进行共价固定化。此方法不仅可以通过合理地设计与选择对进行酶有针对性的固定化,同时形成的共价键使酶与载体之间的固定更加牢固,不易脱落。我们利用甲酰甘氨酸生成酶(FGE)能够识别硫酸酯酶序列中高度保守序列LCXPXR,并可以催化其中的半胱氨酸转化成含有一个醛基的甲酰甘氨酸(FGly)的特性。将这六个保守序列通过基因工程引入目标酶的蛋白氨基酸中,使目标蛋白经FGE的催化修饰带有特异性的醛基功能团,从而获得含有醛基标签的重组酶蛋白。以商用质粒载体pET-28a为改造骨架,将其用于纯化表达的组氨酸标签(组氨酸标签)替换为醛基标签(醛基标签),成为具有通用性的可以用于构建含有特异性醛基标签的重组蛋白表达载体。并且利用质粒载体pET-28a在位于多克隆位点的N、C端分别含有一个组氨酸标签的特点,我们构建了四个表达载体亚型:无组氨酸标签的pET-28aDH、N端含有醛基标签的pET-28aNQ、C端含有醛基标签的pET-28aCQ以及两端均含有醛基标签的pET-28aDQ。之后选用了4个不同来源的酶作为模式酶来构建含有醛基标签的酶,分别为嗜热酰基肽释放酶ST0779、嗜热酯酶APE1547、嗜热脱氯酶ST2570以及脂肪酶LipA,并对不同位置引入醛基标签对酶蛋白的表达和酶活的影响进行了系统研究。研究结果在蛋白的N、C端分别引起醛基标签,其目的蛋白表达量及酶活力均受到不同程度的影响;而两端同时引入醛基标签,对蛋白的表达及酶活力都出现大幅度下降。同时对修饰后的酶进行了固定化研究,测定酶固定化效率、稳定性以及回收利用率。结果显示,固定化的稳定化有所提高,固定化过程中有针对性无醛基标签蛋白不能固定于载体上。 一直以来酶都被认为是具有专一性、特异性,只对一类反应具有高度识别性的生物催化剂,但是最近一些研究发现一些酶能够利用主反应的活性位点催化不同于其主要酶活性反应,即为酶的催化非特异性。此特性不仅拓展了酶促有机合成的反应类型,提高了酶在有机合成领域的应用价值,同时也对研究不同酶的进化关系提供重要的线索。其中研究最为广泛的是来自/β水解酶家族一类丝氨酸水解酶,可催化C-C和C-N键形成的反应。嗜热酰基肽释放酶ST0779属于/β水解酶家族,其催化三联体与脂肪酶的催化三联体相一致,我们推测其也可能具有酶的催化非特异性特性。本论文首次尝试研究并发现ST0779可以进行非特异性催化aldol反应。脂肪酶PPL是目前研究报道中非特异性催化aldol反应效果最好的酶。因此我们用脂肪酶PPL作为对照来比较反应速率、产率以及产物的立体选择性。实验发现,以4-对硝基苯甲醛和丙酮为底物,在55℃下ST0779催化4h即可达到96.1%的转化率。而PPL在30℃催化48h才达到39.2%的转化率,ST0779的非特异性催化aldol反应效率要高于目前已报道过的酶非特异性催化aldol反应效率。 为了更好的理解ST0779和PPL非特异性催化aldol反应机理,我们通过荧光光谱来研究底物分子丙酮、对硝基苯甲醛与酶分子之间相互作用。通过分析得到底物与蛋白的结合常数、结合位点以及结合力类型,结合酶分子结构来解释ST0779非特异性催化aldol反应的机制。
【关键词】:
【学位授予单位】:吉林大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2015
【分类号】:Q814.2
【目录】:
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