7种鸡形目鸟类线粒体基因组的比较及谱系基因组学研究

  本文关键词：7种鸡形目鸟类线粒体基因组的比较及谱系基因组学研究，由笔耕文化传播整理发布。

7种鸡形目鸟类线粒体基因组的比较及谱系基因组学研究

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内容提示：鸡形目是鸟类中一个重要类群，与人类生活关系密切。虽然已有很多学者采用不同类型数据对鸡形目的系统发育关系进行了研究，但是由于该类群部分分支经历了快速的适应辐射，鸡形目内部的系统发育关系仍存在争议。近年来，，线粒体基因组序列被广泛运用到鸡形目多个层面的研究中，并被认为是重建鸡形目系统发育关系和进化历史的一个有效工具。本研究测定了7种鸡形目物种（海南山鹧鸪、中华鹧鸪、斑尾榛鸡、褐马鸡、白马鸡、灰山鹑和暗腹雪鸡）的线粒体基因组序列，联合数据库已有的其他鸡形目鸟类线粒体基因组序列，采用比较基因组学、谱系基因组学方法对鸡形目各类群进行了分析。得到的主要结论如下： 1. 7种鸡形目鸟类线粒体基因组长度介于16658-16730bp之间，编码37个基因（13个蛋白编码基因，2个rRNA基因和22个tRNA基因），外加1个控制区。线粒体基因组组成和基因排序与其他已发表的鸡形目鸟类一致。 2. 鸡形目山鹧鸪属、榛鸡属、马鸡属、山鹑属和雪鸡属的属内比较研究发现，同一属内物种的线粒体基因组碱基组成、偏向性、密码子使用频率、RNA二级结构、控制区结构等方面类似。除马鸡属部分基因外，其他属蛋白编码基因的Ka/Ks值均小于1，显示出受到了纯化选择作用。 3. 鸡形目鸟类的线粒体基因组长度介于16658-16841bp之间，平均长度为16705b

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