哈氏噬纤维菌中蛋白折叠和定位相关基因的功能研究
发布时间：2021-01-03 16:38
哈氏噬纤维菌（Cytophaga hutchinsonii）是一株广泛存在于土壤中的好氧的纤维素降解细菌,属于拟杆菌门（Bacteroidetes）。不同于已知的游离纤维素酶协同降解机制和纤维小体降解机制,C.hutchinsonii采用一种全新且未知的方式降解纤维素,其在降解纤维素时需要菌体与纤维素直接接触,没有外切纤维素酶,并且多数纤维素酶活是细胞偶联的。此外,C.hutchinsonii还具有滑动能力,但没有鞭毛或菌毛,其滑动机制也是未解之谜。本实验室前期研究发现C.hutchinsonii存在细胞表面和周质空间两种纤维素降解途径,而且外膜蛋白在细胞表面参与纤维素的吸附和解构。因此蛋白在周质空间的正确折叠、分泌以及外膜上的定位决定了其功能的正常发挥。二硫键氧化还原酶催化蛋白质的半胱氨酸残基之间形成二硫键,对稳定蛋白质空间结构和功能具有重要作用,在拟杆菌中少有报道。前期研究发现C.hutchinsonii中未知功能蛋白CHU-1165,与同样来自拟杆菌门的Flavobacterium psychrophilum中推测的二硫键氧化还原酶TlpB序列一致性为32%,CHU1<...
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：121 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１纤维素单元分子结构??
?ＣｅｌｌｕＪｏｓｏｍｅ?＜??Ｂａｃｔｅｒｉａｌ?Ｃｅｌｌ?〇?＾??Ｅｘｏｇｌｕｃａｎａｓｅ?Ｅｎｄｏｇｌｕｃａｎａｓｅ?（＾－ｇｌｕｃｏｓｉｄａｓｅ?Ｓｃａｆｆｏｌｄｉｎ??ＣｏｈｅｓｉｒＶＯｏｃｘｅｒ?Ｏ?Ｇｌｕｃｏｓｅ?〇〇?Ｃｅｌｌｏｔｘｏｓｅ??Ｆｉｇ．?１－２?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｄｉａｇｒａｍｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｎｏｎｃｏｍｐｌｅｘｅｄ?ａｎｄ?ｃｏｍｐｌｅｘｅｄ?ｃｅｌｌｕｌａｓｅ?ｓｙｓｔｅｍｓ?（Ｚｈｕ?ａｎｄ??ＭｃＢｒｉｄｅ?２０１７）??图１－２游离纤维素酶系和纤维素酶复合体纤示意图??１．３．２．３第三种降解机制??尽管上述两种纤维素降解机制在纤维素降解微生物中被广泛采用，但还是存??在少数微生物具有特殊的纤维素降解特点。好氧的哈氏噬纤维菌??和厌氧的产玻拍酸丝状杆菌（Ｆ／ｆｏ－ｏＡｆｌｃ／ｅｒｓ〃（：ｃ／？ｏｇｅｎｅｓ）都能高效彻??底的降解结晶纤维素，但他们既没有游离的纤维素酶系，也没有纤维小体结构，??在降解纤维素时菌体需要与纤维素直接接触，而且多数纤维素酶活是细胞偶联的，??可能采用一种新的纤维素降解策略（Ｗｉｌｓｏｎ?２０１１；?Ｗｉｌｓｏｎ?２００９；?Ｗｉｌｓｏｎ?２００８）。??５??
／／？ｓｏｍ７和Ａ?？？ｗｃｃ／／？ｏｇｅ／？ｅｓ的基因组分析发现，它们没有编码??外切纤维素酶的基因，所含的纤维素酶不含能与结晶纤维素结合的碳水化合物结??合模块（ＣＢＭ），也没有编码?ｄｏｃｋｅｒｉｎ?或?ｓｃａｆｆｏｌｄｉｎｄ?的基因（Ｓｕｅｎｅｔａｌ．?２０１１；Ｘｉｅ??ｅｔ?ａｌ．?２００７）。因此他们采用了第三种纤维素降解策略。??２００９年，Ｗｉｌｓｏｎ针对ｎｊ能利用的第三种纤维素降解机制提出??了一种假说（Ｗｉｌｓｏｎ２００９），该假说认为纤维素是在细胞内被降解的。如图１－３所??示，Ｃ．?的细胞表面可能存在非酶的蛋白或蛋白复合体形式，将单链??纤维素分子从纤维素纤维中分离出来，单链纤维素通过外膜通道被运送到周质空??间，在周质空间被纤维素酶降解。细胞表面蛋白如何将单链纤维素从纤维素纤维??素中剥离出来，并将其运送到周质空间是验证该机制的关键。??Ｃｅｌｌｕｌｏｓｅ?ｆｉｂｅｒ????Ｉ?１１＇?Ｅｘｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒ?ｃｅｌｌｕｌｏｓｅ??｜｜ｊ?Ｉ?「ｄｉｓｒｕｐｔｉｎｇ?ｃｏｍｐｌｅｘ??Ｉｆ?Ｉ?＼ｔ＼ｊ?＼??Ｉ?ＨＩ?｜?＼?■１０＊?ｒ?Ｉｎｔｅｇｒａｌ?ｍｅｍｂｒａｎｅ??Ｇ?Ｉ?）?Ｂａｃｔｅｒｉａｌ?ｉ?［?ｐｏｌｙｓａｃｃｈａｒｉｄｅ??ＨＩＩ??ｃ？１１?＾?ｉ?ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒｓ??Ｉ?ｌ?Ｊ?ｌ……［ｉ－Ｌｌｈｒ??圓ｖｙｙ?丄??Ｐｅｎｐｌａｓｍｉｃ?ｓｐａｃｅ??ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?ｅｎｄｏｃｅｌｌＬｉｌａｓｅｓ??Ｆｉｇ．?１－３?Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ?ｍｅｃｈａｎｉｓｍ?ｆｏｒ?ｃｅｌｌｕｌｏｓｅ?ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎ?ｂｙ?Ｃ?ｈｕｔｃｈ
【参考文献】：
博士论文
[1]Cytophaga hutchinsonii基于FLP-FRT重组系统敲除方法的建立及Ⅸ型分泌系统相关基因的研究[D]. 王颖.山东大学 2014
本文编号：2955139
【文章来源】：山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：121 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１纤维素单元分子结构??
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【参考文献】：
博士论文
[1]Cytophaga hutchinsonii基于FLP-FRT重组系统敲除方法的建立及Ⅸ型分泌系统相关基因的研究[D]. 王颖.山东大学 2014
本文编号：2955139
本文链接：https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/jckxbs/2955139.html
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