河南华溪蟹ShToll1和ShToll3对镉暴露和嗜水气单胞菌攻毒的免疫应答研究
发布时间:2021-07-23 06:56
Toll信号通路是无脊椎动物先天性免疫中的重要一环,对于无脊椎动物抵抗细菌、真菌和病毒等感染具有重要作用。虽然,在甲壳动物中已经鉴定出一些Toll基因,但是在河南华溪蟹(Sinopotamon henanense)中还没有发现。此外,镉(cadmium,Cd)对Toll基因的影响,在生活于底泥中、易累积重金属的溪蟹类中尚未见报道。我们对河南华溪蟹肝胰腺组织的转录组分析发现,Cd暴露使Toll3基因表达降低。因此,本课题将从以下四个方面对河南华溪蟹ShToll1和ShToll3基因在Cd暴露和嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)攻毒的应答模式进行研究。主要研究内容包括以下四个方面:1.河南华溪蟹ShToll1和ShToll3基因的序列分析与分布模式。通过RACE方法,克隆获得Shtoll1和Shtoll3基因全长序列;预测ShToll1和ShToll3的蛋白结构域,分析ShToll1和ShToll3蛋白各功能结构域的特点;同时,构建相似物种间的系统发育进化树,预测ShToll1和ShToll3的进化地位,并推测它们的功能。同时,取河南华溪蟹血淋巴、鳃、肝胰腺、中肠、肌...
【文章来源】:山西大学山西省
【文章页数】:123 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本学位论文的研究内容和研究方法
河南华溪蟹ShToll1和ShToll3对镉暴露和嗜水气单胞菌攻毒的免疫应答研究18Shtoll3基因。(a)(b)图2.1河南华溪蟹Shtoll1(a)和Shtoll3(b)全长序列凝胶电泳1,Shtoll1;2,Shtoll3Figure2.1Gelelectrophoresisresultsoffull-lengthsequenceofShtoll1(a)andShtoll3(b)fromS.henanense1,Shtoll1;2,Shtoll3Shtoll1基因的全长cDNA长度为4746bp,ORF区3033bp可编码1011个氨基酸,5’UTR为255bp,3’UTR为1713bp(图2.2)。氨基酸序列分析表明,ShToll1
第二章河南华溪蟹Shtoll1和Shtoll3基因的克垄生物信息学分析与组织表达模式19含有一个典型的Toll蛋白结构,其中包括:(1)由17个LRR、2个LRRCT和1个LRRNT组成的胞外域(氨基酸144-786);(2)跨膜段(氨基酸794-816);(3)胞内TIR结构域(氨基酸846-984)(图2.3)。在胞外域(图2.2)中预测了19个潜在的N-糖基化位点。三维结构预测结果发现,ShToll1可以形成经典的U形结构,胞外域卷曲并折叠成马蹄形(图2.4)。对细胞外LRR结构进行序列图谱分析,发现所有LRR结构符合"xLxxLxLxxNxφxxφxxxxFxx"的保守序列模式,其中x表示任何氨基酸,N表示丝氨酸、天冬氨酸、半胱氨酸或苏氨酸,φ表示任何疏水氨基酸,L和F表示其他疏水氨基酸(图2.5)。图2.2河南华溪蟹Shtoll1基因全长序列Figure2.2Full-lengthsequenceofShtoll1fromS.henanense
【参考文献】:
期刊论文
[1]湖北地区暴发病池塘中嗜水气单胞菌的遗传多样性和毒力特征研究[J]. 张旭杰,杨五名,李彤彤,李爱华. 水生生物学报. 2013(03)
[2]中国大陆特有华溪蟹属分布格局探讨(甲壳纲,十足目,溪蟹科)[J]. 陈少华,朱春潮,张小燕,邹节新,周宪民. 动物分类学报. 2012(02)
[3]温度变化对锯缘青蟹免疫因子的胁迫影响[J]. 丁小丰,杨玉娇,金珊,王国良. 水产科学. 2010(01)
硕士论文
[1]环境胁迫对养殖锯缘青蟹主要免疫因子的影响[D]. 周素琴.中国海洋大学 2006
本文编号:3298841
【文章来源】:山西大学山西省
【文章页数】:123 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
本学位论文的研究内容和研究方法
河南华溪蟹ShToll1和ShToll3对镉暴露和嗜水气单胞菌攻毒的免疫应答研究18Shtoll3基因。(a)(b)图2.1河南华溪蟹Shtoll1(a)和Shtoll3(b)全长序列凝胶电泳1,Shtoll1;2,Shtoll3Figure2.1Gelelectrophoresisresultsoffull-lengthsequenceofShtoll1(a)andShtoll3(b)fromS.henanense1,Shtoll1;2,Shtoll3Shtoll1基因的全长cDNA长度为4746bp,ORF区3033bp可编码1011个氨基酸,5’UTR为255bp,3’UTR为1713bp(图2.2)。氨基酸序列分析表明,ShToll1
第二章河南华溪蟹Shtoll1和Shtoll3基因的克垄生物信息学分析与组织表达模式19含有一个典型的Toll蛋白结构,其中包括:(1)由17个LRR、2个LRRCT和1个LRRNT组成的胞外域(氨基酸144-786);(2)跨膜段(氨基酸794-816);(3)胞内TIR结构域(氨基酸846-984)(图2.3)。在胞外域(图2.2)中预测了19个潜在的N-糖基化位点。三维结构预测结果发现,ShToll1可以形成经典的U形结构,胞外域卷曲并折叠成马蹄形(图2.4)。对细胞外LRR结构进行序列图谱分析,发现所有LRR结构符合"xLxxLxLxxNxφxxφxxxxFxx"的保守序列模式,其中x表示任何氨基酸,N表示丝氨酸、天冬氨酸、半胱氨酸或苏氨酸,φ表示任何疏水氨基酸,L和F表示其他疏水氨基酸(图2.5)。图2.2河南华溪蟹Shtoll1基因全长序列Figure2.2Full-lengthsequenceofShtoll1fromS.henanense
【参考文献】:
期刊论文
[1]湖北地区暴发病池塘中嗜水气单胞菌的遗传多样性和毒力特征研究[J]. 张旭杰,杨五名,李彤彤,李爱华. 水生生物学报. 2013(03)
[2]中国大陆特有华溪蟹属分布格局探讨(甲壳纲,十足目,溪蟹科)[J]. 陈少华,朱春潮,张小燕,邹节新,周宪民. 动物分类学报. 2012(02)
[3]温度变化对锯缘青蟹免疫因子的胁迫影响[J]. 丁小丰,杨玉娇,金珊,王国良. 水产科学. 2010(01)
硕士论文
[1]环境胁迫对养殖锯缘青蟹主要免疫因子的影响[D]. 周素琴.中国海洋大学 2006
本文编号:3298841
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/jckxbs/3298841.html
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