甜瓜株型和抗白粉病性状的遗传与全基因组关联分析

发布时间：2021-09-30 09:11

　　甜瓜（Cucumis melo L.）是一个世界范围广泛种植的园艺作物,多样性较高,许多农艺性状如株型性状、抗白粉病、耐裂果性状对甜瓜的生产十分重要。深入挖掘、利用甜瓜重要性状遗传变异对改良甜瓜品种,促进甜瓜产业化发展至关重要。本研究以甜瓜为实验材料,开展甜瓜农艺性状的遗传分析。并利用简化基因组测序与SNP （Single nucleotide polymorphisms）分型技术,对甜瓜株型性状、抗白粉病性状等重要农艺性状进行全基因组关联分析（Genome-wide association studies, GWAS）,为甜瓜育种与后续研究提供借鉴。主要研究内容与结果如下：1.以哈密瓜‘AM-5’为母本,网纹甜瓜‘RE-19’为父本,构建P1、P2、Fl和F2四世代遗传群体,对甜瓜节间长、侧枝长、主茎直径、叶面积和果皮颜色进行遗传分析,发现甜瓜果皮颜色为质量性状,受单基因控制,其它性状为数量性状,受多基因控制。采用主基因+多基因遗传模型对4个数量性状进行分析发现：节间长和侧枝长遗传符合两对加性-显性主基因+加性-显性多基因模型,主茎直径遗传符合两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性... 

【文章来源】：浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：102 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
致谢
缩略词表
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 甜瓜生物学特征
    1.2 研究背景
2 文献综述
    2.1 甜瓜的起源与分类
    2.2 甜瓜重要农艺性状的研究进展
        2.2.1 甜瓜株型性状
        2.2.2 甜瓜抗白粉病性状
        2.2.3 甜瓜耐裂果性状
    2.3 甜瓜遗传图谱与分子标记的研究进展
    2.4 SNP标记的高通量开发与分型
    2.5 全基因组关联分析研究进展
    2.6 本研究的目的与意义
3 甜瓜株型性状的遗传分析
    3.1 引言
    3.2 材料与方法
        3.2.1 试验材料
        3.2.2 试验方法
        3.2.3 统计分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 四世代株型相关性状值分布
        3.3.2 遗传模型的选择和检测
        3.3.3 遗传参数的估计
    3.4 讨论
4 甜瓜株型性状全基因组关联分析
    4.1 引言
    4.2 材料与方法
        4.2.1 试验材料
        4.2.2 试验方法
        4.2.3 性状调查
        4.2.4 甜瓜基因组DNA提取
        4.2.5 RAD文库构建与测序
        4.2.6 SNP基因型分型
        4.2.7 全基因组关联分析
    4.3 结果与分析
        4.3.1 表型数据分析
        4.3.2 限制性内切酶与测序深度的选择
        4.3.3 测序数据的统计
        4.3.4 甜瓜五个性状的全基因组关联分析
    4.4 讨论
5 甜瓜耐裂果性状的遗传分析
    5.1 引言
    5.2 材料与方法
        5.2.1 试验材料
        5.2.2 试验方法
        5.2.3 性状调查
        5.2.4 统计分析
    5.3 结果与分析
        5.3.1 甜瓜耐裂果性状鉴定方法和评价标准
        5.3.2 六世代耐裂果性状值分布
        5.3.3 遗传模型的选择和检测
        5.3.4 遗传参数的估计
    5.4 讨论
6 甜瓜抗白粉病性状的全基因组关联分析
    6.1 引言
    6.2 材料与方法
        6.2.1 试验材料
        6.2.2 试验方法
        6.2.3 甜瓜基因组DNA提取
        6.2.4 白粉病接种、症状及病原菌形态观察
        6.2.5 抗病性调查与混池构建
        6.2.6 2b-RAD文库构建与测序
        6.2.7 SNP calling与Genotyping
        6.2.8 全基因组关联分析
    6.3 结果与分析
        6.3.1 白粉病病原与免疫叶片镜检
        6.3.2 甜瓜大棚内接种白粉病抗性遗传规律分析
        6.3.3 测序数据的统计与SNP基因型分型
        6.3.4 甜瓜抗白粉病性状的全基因组关联分析
    6.4 讨论
7 总结、展望与创新性
    7.1 全文总结
    7.2 本研究创新性
    7.3 后续展望
参考文献
附录一
附录二
附录三
攻读博士学位期间主要的研究成果


【参考文献】：
期刊论文
[1]榨菜瘤状茎膨大性状遗传分析[J]. 张郎郎,刘斌,李俊星,陈利萍.  核农学报. 2014(01)
[2]罗汉果裂果的预防试验初报[J]. 彭小列,田启建,陈继富,张继贤,刘世彪.  湖南农业科学. 2012(19)
[3]甜瓜（Cucumis melo L.）种下分类专论[J]. 林德佩.  中国瓜菜. 2012(05)
[4]新疆红枣裂果机理研究进展[J]. 陈辉惶,李建贵,张俊,杜妍.  新疆农业科学. 2012(06)
[5]辣椒果实性状主基因+多基因遗传分析[J]. 陈学军,方荣,周坤华,缪南生,黄长林.  西北植物学报. 2012(02)
[6]甜瓜遗传图谱的构建及果实与种子QTL分析[J]. 王贤磊,高兴旺,李冠,王惠林,耿守东,康锋,聂祥祥.  遗传. 2011(12)
[7]上海地区西甜瓜白粉病菌生理小种的鉴定[J]. 顾海峰,张旭,张文芳,金春英,徐兰,卢小露,樊静华.  上海农业学报. 2010(04)
[8]柚裂果研究进展[J]. 李进学,朱春华,高俊燕,杨恩聪,岳建强.  亚热带农业研究. 2010(03)
[9]中国栽培甜瓜植物的起源、分类及进化[J]. 林德佩.  中国瓜菜. 2010(04)
[10]西瓜裂果性状的基因型研究[J]. 江海坤,袁希汉,章镇,苏小俊,徐海,宋波,陈龙正,安林海,单奇伟,张其安.  华北农学报. 2009(S1)

硕士论文
[1]哈密瓜SSR永久遗传图谱构建及重要农艺性状定位分析[D]. 陆芳.东北农业大学 2009



本文编号：3415557