入侵种喜旱莲子草（Alternanthera philoxeroides）表观遗传变异的稳定性及其适应意义
发布时间：2021-11-10 07:59
表观遗传修饰可在不改变DNA序列的情况下调控基因表达、产生表型变异,在生物体中广泛存在。表观遗传变异响应环境刺激,影响植物对异质环境的适应。若表观遗传变异对环境的响应是适应性的并且能够遗传,那么很有可能影响着进化过程。对于无性生殖的物种而言,表观遗传变异的进化作用尤其值得关注。入侵物种喜旱莲子草（Alternanthera philoxeroides）原产于南美洲,是一种恶性入侵植物。入侵中国的喜旱莲子草种内遗传多样性很低,主要通过克隆繁殖进行扩散,但是对不同的地理环境有广泛的适应性。因此,推测喜旱莲子草种内的表观遗传变异可能在其适应不同地理环境过程中发挥着重要的作用。然而目前对喜旱莲子草表观遗传变异在不同地理环境中的多态性以及稳定性还缺乏有力的证据,在一定程度上制约了对喜旱莲子草入侵机制和入侵力的了解。本研究综合运用野外调查与同质园、人工气候箱多代栽培实验,结合基因组DNA甲基化分析技术以及二代测序技术,旨在研究分布在中国不同地区喜旱莲子草种群的遗传多样性与表观遗传变异,了解表观遗传变异的地理分化格局;探讨表观遗传变异在不同环境下的稳定性以及与环境因子之间的关系;验证显著的表观遗传分...
【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校
【文章页数】：137 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
表观遗传修饰的类型
入侵种喜旱莲子草表观遗传变异的稳定性及其适应意义侧胞嘧啶甲基化，其它甲基化情况均不能识别；MspI 能够识别 DN链上内侧的甲基化胞嘧啶，但是无法识别外侧胞嘧啶甲基化的情况aII 和 MspI 酶切产物中，往往出现 3 种情况：1. HpaII 识别但 MspI H1M0（1为有酶切产物，0为无酶切产物）；2. MspI 能识别但 Hpa即 H0M1；3. HpaII 和 MspI 都能识别，即 H1M1，这种情况往往是点。双链外侧甲基化或内外侧都发生甲基化的情况无法被 HpaII 或 M变导致的非 5’-CCGG-3’位点也无法被识别出来，因此这些情况 MSA测到，即 H0M0（表 1.1）。
图 1.3 mSLAF 技术流程。Fig. 1.3 Schematic diagram of the mSLAF procedure. 表观遗传变异的生态、进化意义上所述，DNA 甲基化在是生物体表观遗传变异的重要组成部分。相表观遗传修饰（如组蛋白修饰，非编码 RNA 等）DNA 甲基化在生遍，进化上相对保守，具有重要的生物学意义，很可能在物种进化要的作用。目前对于 DNA 甲基化的研究也相对成熟和广泛，因此 异是本研究主要关注的表观遗传变异。当然，不可否认，其它的表具有相当重要的作用。观遗传变异的生物学意义
【参考文献】：
期刊论文
[1]克隆整合有利于喜旱莲子草（Alternanthera philoxeroides）入侵[J]. 方龙香,吕晓倩,奚道国,游文华,依成武,杜道林. 湖泊科学. 2017(05)
[2]表观遗传学及其研究方法[J]. 朱锋,王旭,刘倩莹,陆启荣,黄德玉,刘振利,戴梦红,袁宗辉. 现代生物医学进展. 2017(12)
[3]基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法[J]. 马浪浪,梁振娟,先新,罗仕文,李清超,梁黔云. 生物技术通报. 2015(07)
[4]喜旱莲子草入侵机制及防治策略研究进展[J]. 王颖,李为花,李丹,张震. 浙江农林大学学报. 2015(04)
[5]不同水陆环境中喜旱莲子草甲基化调控因子表达水平和差异表达基因启动子区甲基化状态分析[J]. 邓莹,高乐旋,朱珠,杨继. 植物科学学报. 2014(05)
[6]苦楝和水芹菜对空心莲子草的化感防治作用[J]. 李朝会,陈斯,岳春雷,郭玮龙,左照江,金水虎. 浙江农林大学学报. 2014(03)
[7]表观遗传修饰调控非生物胁迫应答提高植物抗逆性[J]. 潘丽娜. 遗传. 2013(06)
[8]葎草水浸提物对外来入侵植物喜旱莲子草营养生长的影响[J]. 张震,徐丽,王育鹏,李丹. 西北植物学报. 2012(09)
[9]芦苇水提物对喜旱莲子草化感作用分析[J]. 李娟,刘伟,杜静丽. 上海化工. 2012(08)
[10]不同土壤水分和养分条件下喜旱莲子草与同属种生长状况的比较研究[J]. 王坤,杨继,陈家宽. 生物多样性. 2010(06)
博士论文
[1]高锰胁迫下空心莲子草的生理生化特性和草甘膦耐性研究[D]. 朱金文.浙江大学 2008
[2]入侵种喜旱莲子草在异质生境中的适应对策研究[D]. 耿宇鹏.复旦大学 2006
硕士论文
[1]入侵植物喜旱莲子草对南方菟丝子寄生的生态响应研究[D]. 李永慧.山西师范大学 2012
本文编号：3486888
【文章来源】：云南大学云南省 211工程院校
【文章页数】：137 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
表观遗传修饰的类型
入侵种喜旱莲子草表观遗传变异的稳定性及其适应意义侧胞嘧啶甲基化，其它甲基化情况均不能识别；MspI 能够识别 DN链上内侧的甲基化胞嘧啶，但是无法识别外侧胞嘧啶甲基化的情况aII 和 MspI 酶切产物中，往往出现 3 种情况：1. HpaII 识别但 MspI H1M0（1为有酶切产物，0为无酶切产物）；2. MspI 能识别但 Hpa即 H0M1；3. HpaII 和 MspI 都能识别，即 H1M1，这种情况往往是点。双链外侧甲基化或内外侧都发生甲基化的情况无法被 HpaII 或 M变导致的非 5’-CCGG-3’位点也无法被识别出来，因此这些情况 MSA测到，即 H0M0（表 1.1）。
图 1.3 mSLAF 技术流程。Fig. 1.3 Schematic diagram of the mSLAF procedure. 表观遗传变异的生态、进化意义上所述，DNA 甲基化在是生物体表观遗传变异的重要组成部分。相表观遗传修饰（如组蛋白修饰，非编码 RNA 等）DNA 甲基化在生遍，进化上相对保守，具有重要的生物学意义，很可能在物种进化要的作用。目前对于 DNA 甲基化的研究也相对成熟和广泛，因此 异是本研究主要关注的表观遗传变异。当然，不可否认，其它的表具有相当重要的作用。观遗传变异的生物学意义
【参考文献】：
期刊论文
[1]克隆整合有利于喜旱莲子草（Alternanthera philoxeroides）入侵[J]. 方龙香,吕晓倩,奚道国,游文华,依成武,杜道林. 湖泊科学. 2017(05)
[2]表观遗传学及其研究方法[J]. 朱锋,王旭,刘倩莹,陆启荣,黄德玉,刘振利,戴梦红,袁宗辉. 现代生物医学进展. 2017(12)
[3]基于高通量测序技术检测全基因组DNA甲基化水平的方法[J]. 马浪浪,梁振娟,先新,罗仕文,李清超,梁黔云. 生物技术通报. 2015(07)
[4]喜旱莲子草入侵机制及防治策略研究进展[J]. 王颖,李为花,李丹,张震. 浙江农林大学学报. 2015(04)
[5]不同水陆环境中喜旱莲子草甲基化调控因子表达水平和差异表达基因启动子区甲基化状态分析[J]. 邓莹,高乐旋,朱珠,杨继. 植物科学学报. 2014(05)
[6]苦楝和水芹菜对空心莲子草的化感防治作用[J]. 李朝会,陈斯,岳春雷,郭玮龙,左照江,金水虎. 浙江农林大学学报. 2014(03)
[7]表观遗传修饰调控非生物胁迫应答提高植物抗逆性[J]. 潘丽娜. 遗传. 2013(06)
[8]葎草水浸提物对外来入侵植物喜旱莲子草营养生长的影响[J]. 张震,徐丽,王育鹏,李丹. 西北植物学报. 2012(09)
[9]芦苇水提物对喜旱莲子草化感作用分析[J]. 李娟,刘伟,杜静丽. 上海化工. 2012(08)
[10]不同土壤水分和养分条件下喜旱莲子草与同属种生长状况的比较研究[J]. 王坤,杨继,陈家宽. 生物多样性. 2010(06)
博士论文
[1]高锰胁迫下空心莲子草的生理生化特性和草甘膦耐性研究[D]. 朱金文.浙江大学 2008
[2]入侵种喜旱莲子草在异质生境中的适应对策研究[D]. 耿宇鹏.复旦大学 2006
硕士论文
[1]入侵植物喜旱莲子草对南方菟丝子寄生的生态响应研究[D]. 李永慧.山西师范大学 2012
本文编号：3486888
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