化学空间分析软件与Web开发及其在NA抑制剂设计中的应用
发布时间:2021-03-31 09:34
随着药物筛选技术的发展,药物研发数据呈指数级增长,涉及到分子结构、活性、理化性质、毒性、靶点、基因和信号通路等多维度的信息。这些医药大数据所分布的化学空间和维度越来越大,给药物数据分析和可视化带来了巨大的机遇和挑战。为了从这些化学空间里面找到药物研究的活性小分子,需要采用多种分析和可视化手段,从不同的角度,聚焦到更小空间来进行研究。因此本论文开发了化学空间分析与可视化工具来辅助药物设计。具体的研究内容如下:(1)化学空间分析与可视化软件和Web开发基于开源的HighCharts和vis.js图表插件,根据化学空间分析的需求,开发可显示化学信息的Python可视化工具包easyHighcharts和easyVisjs;基于以上可视化工具和RDKit,开发模块化的化学空间分析Python工具包pyChemspace,以实现化合物库理化性质、分子结构和片段信息的分析与可视化;为进一步降低药物研发者分析化学空间的门槛,加快数据分析的效率,基于以上研究,开发了化学空间交互式分析与可视化Web服务器IChemSpace(http://mwxiao.com/ichemspace)。(2)流感神经氨酸...
【文章来源】:湖南大学湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:176 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
现有的化学空间大小呈指数级增长
药物发现与开发中常见的化学反应类型如表1.4,总结了近年来出现的一些虚拟化学空间资源
COX-1/COX-2抑制活性(2)气泡图
【参考文献】:
硕士论文
[1]含噻唑环或哌嗪环的酰胺衍生物的合成与NA抑制活性研究[D]. 崔满营.湖南大学 2019
本文编号:3111210
【文章来源】:湖南大学湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:176 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
现有的化学空间大小呈指数级增长
药物发现与开发中常见的化学反应类型如表1.4,总结了近年来出现的一些虚拟化学空间资源
COX-1/COX-2抑制活性(2)气泡图
【参考文献】:
硕士论文
[1]含噻唑环或哌嗪环的酰胺衍生物的合成与NA抑制活性研究[D]. 崔满营.湖南大学 2019
本文编号:3111210
本文链接:https://www.wllwen.com/shoufeilunwen/xxkjbs/3111210.html