自闭症“药物-靶点”关联网络分析及关系预测
发布时间:2023-02-15 15:32
目的:通过建立自闭症药物网络以及建立自闭症“药物-靶点”关联网络,通过网络分析方法和计算机技术,为自闭症未来的治疗提供潜在的靶点和药物,为自闭症患者推荐合理的新疗法。数据与方法:本文以DrugBank全药数据库为数据源,通过Python抽取药物-靶点关系数据,共抽取到2527条药物数据和3786条靶点数据。基于2527条药物数据建立药物网络,对药物网络进行网络特点分析,并对药物网络进行聚类分析,通过观察每个药物社区内部的药物分类特征,发现某些与社区内药物适应证有明显差异的药物(自闭症临床药物除外),再通过查阅相关资料来探究其是否与本社区内主要适应证具有相关性,通过自闭症相关发病机制筛选出与自闭症治疗具有相关性的药物作为自闭症潜在治疗药物。基于2527条药物数据和3786条靶点数据建立“药物-靶点”二分网络,选择基于物质扩散的二分网络推荐算法,开展自闭症相关的药物和靶点推荐,为发现自闭症治疗领域的潜在价值提供思路。结果:对药物网络进行网络特点分析和聚类分析发现有5个药物表现出良好的药物价值属性,分别为 Zinc(锌)、amitriptyline(阿米替林)、Olanzapine(奥氮平)...
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 问题的提出与研究意义
1.2 国内外相关研究综述
1.3 技术路线及流程
1.4 研究方法
1.5 数据来源与获取
1.5.1 数据来源
1.5.2 数据获取
1.6 论文框架
1.7 论文的创新点
2 自闭症相关药物网络研究
2.1 药物网络特点分析
2.1.1 社会网络分析
2.1.2 PageRank算法分析
2.2 药物网络聚类分析
2.2.1 自闭症临床用药聚类分析
2.2.2 自闭症特定适应证的潜力药物发现
3 基于“药物-靶点”二分网络开展潜在靶点和药物推荐研究
3.1 二分网络推荐算法
3.1.1 算法简介
3.1.2 算法原理
3.2 自闭症相关药物的靶点推荐及其有效性验证
3.2.1 自闭症相关药物的靶点推荐
3.2.2 推荐结果的有效性验证
3.3 自闭症相关靶点的药物推荐及其有效性验证
3.3.1 自闭症相关靶点的药物推荐
3.3.2 推荐结果的有效性验证
3.4 潜在靶点与药物推荐结果分析
4 结论与讨论
4.1 讨论
4.2 结论
4.3 建议
4.4 研究不足与展望
参考文献
致谢
个人简介
本文编号:3743437
【文章页数】:55 页
【学位级别】:硕士
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中文摘要
Abstract
1 引言
1.1 问题的提出与研究意义
1.2 国内外相关研究综述
1.3 技术路线及流程
1.4 研究方法
1.5 数据来源与获取
1.5.1 数据来源
1.5.2 数据获取
1.6 论文框架
1.7 论文的创新点
2 自闭症相关药物网络研究
2.1 药物网络特点分析
2.1.1 社会网络分析
2.1.2 PageRank算法分析
2.2 药物网络聚类分析
2.2.1 自闭症临床用药聚类分析
2.2.2 自闭症特定适应证的潜力药物发现
3 基于“药物-靶点”二分网络开展潜在靶点和药物推荐研究
3.1 二分网络推荐算法
3.1.1 算法简介
3.1.2 算法原理
3.2 自闭症相关药物的靶点推荐及其有效性验证
3.2.1 自闭症相关药物的靶点推荐
3.2.2 推荐结果的有效性验证
3.3 自闭症相关靶点的药物推荐及其有效性验证
3.3.1 自闭症相关靶点的药物推荐
3.3.2 推荐结果的有效性验证
3.4 潜在靶点与药物推荐结果分析
4 结论与讨论
4.1 讨论
4.2 结论
4.3 建议
4.4 研究不足与展望
参考文献
致谢
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