日本三角涡虫铅胁迫下的数字表达谱分析

发布时间：2024-12-27 06:05

　　目前,全球的水污染极其严重,在引起水污染的诸多因素中,重金属的排放与迁移导致的水体污染日益显著,其危害程度也逐日渐增。铅作为重金属污染中毒性较大的一种,其危害十分常见。 生活中铅污染的来源极为广泛。作为具有神经毒性的重金属,其毒性十分严重。对于生物而言,铅毒可以作用与全身各个系统和器官,铅不仅对生物细胞的超微结构影响严重,对神经系统损伤也十分明显,因此,目前关于铅毒理学的研究已成为水体重金属污染的一个热点课题。关于铅的研究目前主要关注于引发机体产生“亚临床毒性”,基因水平的损伤研究进行较少。探究铅毒害胁迫下整体基因的改变和基因表达量的变化、相关代谢变化对于从分子水平研究铅胁迫下的毒理机制及铅损伤后的修复机制十分重要。 日本三角涡虫(Dugesia japonica)属扁形动物门,涡虫纲,生活在淡水环境中。作为淡水污染指示动物,日本三角涡虫在环境水源重金属污染研究评估方面起到重要作用。 本实验采用日本三角涡虫作为实验动物。经醋酸铅溶液(80mg·L-1)处理48h,miRNeasy Mini Kit(217084)试剂盒提取总RNA, Agilent2100测定总RNA的浓度、...

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摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 转录组测序技术的发展
        1.1.1 转录组的定义
        1.1.2 微阵列技术
        1.1.3 表达序列标签测序
        1.1.4 基因表达系列分析
        1.1.5 转录组测序
    1.2 数字基因表达谱的研究现状
        1.2.1 数字基因表达谱
        1.2.2 数字基因表达谱的应用范围
        1.2.3 数字基因表达谱在探究基因差异表达中的应用
        1.2.4 日本三角涡虫表达谱研究现状
    1.3 日本三角涡虫铅损伤研究现状
        1.3.1 重金属损伤效应的研究现状
        1.3.2 铅损伤对生物体的研究现状
        1.3.3 铅损伤对日本三角涡虫的研究
    1.4 选题意义
        1.4.1 日本三角涡虫的研究现状
        1.4.2 日本三角涡虫铅损伤的研究意义
第2章 材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 实验标本的采集与饲养
        2.1.2 实验材料处理方法
        2.1.3 实验仪器和试剂
        2.1.4 分析软件及数据库
    2.2 试验方法
        2.2.1 日本三角涡虫总RNA的提取
        2.2.2 检测RNA的纯度和完整性
        2.2.3 对RNA进行RNA-Seq测序
        2.2.4 测序评估
        2.2.5 基因功能注释
        2.2.6 差异表达谱的生物信息学分析
第3章 结果分析
    3.1 琼脂糖凝胶电泳
    3.2 日本三角涡虫总RNA的浓度和纯度测定
    3.3 生物信息学分析
        3.3.1 测序数据处理与比对
        3.3.2 测序评估
        3.3.3 基因表达量统计
        3.3.4 差异表达基因筛选
        3.3.5 基因表达模式聚类分析
        3.3.6 Gene Ontology功能显著性富集分析
        3.3.7 Gene Ontology功能分类
        3.3.8 KEGG Pathway显著性富集分析
第4章 讨论
    4.1 数字基因表达谱测序技术在探寻差异基因中的应用
    4.2 测序数据的比对
    4.3 差异表达基因的筛选
    4.4 差异表达基因的GO分析
    4.5 差异表达基因的Pathway分析
        4.5.1 蛋白质合成过程中的相关差异表达基因
        4.5.2 氧化磷酸化途径上的相关差异表达基因
        4.5.3 人类疾病相关的差异表达基因
第5章 结论
参考文献
致谢
攻读学位期间的研究成果



本文编号：4021248