刺萼龙葵种子中适宜内参基因的筛选

发布时间：2022-01-25 16:49

　　入侵杂草刺萼龙葵Solanum rostratum Dunal传播扩散的主要载体是种子,研究其种子休眠萌发基因的激素调控对于其防除具有重要意义,而选择合适的内参基因可以提高相关基因表达分析的准确性。本研究以赤霉素、脱落酸和水处理的刺萼龙葵种子为材料,利用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 4种软件对15个候选内参基因进行表达稳定性评价,并通过检测ABI5（abscisic acid-insensitive 5）的表达验证所筛选的内参基因的适用性。结果表明,对于赤霉素、脱落酸和水处理过的种子,最稳定的内参基因分别为eIF（eukaryotic initiation factor）、SAND（SAND protein family）和ACT（β-actin）;对所有种子样本而言,PP2Acs（a catalytic subunit of protein phosphatase 2A）是最稳定的内参基因。研究结果将为刺萼龙葵种子休眠萌发的遗传调控研究提供重要参考。 

【文章来源】：植物保护. 2020,46(03)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

15个候选内参基因的PCR产物

15个候选内参基因在所有样品中的Cq值范围为4.0～34.5,表现出较大的差异,大多数Cq值在16～25之间(图2)。在所有样品中,18S的Cq值最低(平均Cq=6.4),表明其在种子中的表达水平很高;TIP41的Cq值最高(平均Cq=31.7),表明其在种子中的表达水平很低(图2)。2.2 候选内参基因的稳定性评价

此外,geNorm还可通过计算基因配对变异值(Vn/n+1)确定qPCR分析中所需要的内参基因最佳数量。对于脱落酸和水处理的种子,V3/4值分别为0.119和0.120,说明对于qPCR的归一化分析,使用稳定性排名前三的内参基因是足够的;对于赤霉素处理的种子和所有样品来说,其V4/5值分别为0.124和0.115,应使用稳定性最高的4个内参基因用于qPCR分析(图3)。2.2.2 NormFinder分析

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3608894