广东省江门市捕获鼠类的DNA条形码分析

发布时间：2022-02-20 22:29

　　目的应用DNA条形码技术对广东省江门市新会区农田捕获的鼠类进行种类鉴定和分析,为研究鼠形动物的多样性及鼠害防治奠定基础。方法以2017年12月在广东省江门市新会区农田捕获的45只鼠为研究对象,分别提取鼠基因组DNA,采用通用引物扩增线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）基因片段并进行测序,将测序结果在美国国立生物技术信息中心中进行BLAST序列同源性比对,采用邻接法构建分子进化树,基于双参数模型计算遗传距离。结果 45只鼠样本均能通过PCR扩增出特异性基因片段,通过BLAST比对共鉴定出4种鼠（黄毛鼠、黄胸鼠、褐家鼠和黑缘齿鼠）,37只鼠样本与形态学鉴定结果一致,为黄毛鼠;8只鼠样本存在形态鉴定错误,经复核,其中5只鼠重新鉴定为黄胸鼠,2只为幼年褐家鼠,另外1只为黑缘齿鼠。对45条序列进行比对分析发现有131个变异位点,单倍型分析结果显示有12个不同的单倍型。黄毛鼠种内遗传距离为0～1.2%,不同鼠种间遗传距离为7.1%～11.6%,平均遗传距离为（10.1±0.7）%,分子进化分析结果显示,同一种鼠类的个体聚为一支,支持率均为100%,能区分不同鼠种。结论 DNA条形码技术能够有效区... 

【文章来源】：中国媒介生物学及控制杂志. 2020,31(03)

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品的采集
    1.2 鼠基因组DNA的提取
    1.3 COⅠ基因的扩增与测序
    1.4 COⅠ基因序列分析与系统发育树的构建
2 结果
    2.1 COⅠ基因扩增与假基因甄别
    2.2 COⅠ基因的同源性比对与形态鉴定结果的修订
    2.3 DNA条形码分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]甘肃省鼠疫疫源地啮齿动物DNA条形码分析[J]. 郭丽民,席进孝,盖永志,吴斌,王世明,苗克军,穆洮霞,徐大琴.  中国媒介生物学及控制杂志. 2019(02)
[2]DNA条形码在动植物检测中的应用[J]. 董石,尹玲,杨天天.  国土与自然资源研究. 2019(01)
[3]黑龙江地区农田害鼠发生特点及DNA条形码鉴定技术的应用[J]. 李争光,丛林,王大伟,罗婵,田林,耿远昭,宋英,马晓慧,李宁,刘晓辉.  植物保护. 2018(06)
[4]How many species of Apodemus and Rattus occur in China? A survey based on mitochondrial cyt b and morphological analyses[J]. Shao-Ying Liu,Kai He,Shun-De Chen,Wei Jin,Robert W.Murphy,Ming-Kun Tang,Rui Liao,Feng-Jun Li.  Zoological Research. 2018(05)
[5]DNA条形码技术在兰州中川机场鼠类鉴定中的应用[J]. 陈利伟,赵志亮,邱德义,巩伟兵,王莉,高晓强,刘芳,岳巧云.  中国国境卫生检疫杂志. 2018(02)
[6]中国哺乳动物多样性[J]. 蒋志刚,马勇,吴毅,王应祥,冯祚建,周开亚,刘少英,罗振华,李春旺.  生物多样性. 2015(03)
[7]DNA条形码技术在河北省坝上地区夜行鼠鉴定中的应用[J]. 金圣浩,鲁亮,闫东,史献明,崔耀仁,李玉伟,刘起勇,孔令艳.  中国媒介生物学及控制杂志. 2015(01)
[8]DNA条形码技术在小型兽类鉴定中的探索:以甘肃莲花山为例[J]. 何锴,王文智,李权,罗培鹏,孙悦华,蒋学龙.  生物多样性. 2013(02)
[9]DNA条形码技术在青海海东地区小型兽类鉴定中的应用[J]. 马英,李海龙,鲁亮,刘起勇.  生物多样性. 2012(02)



本文编号：3635936