新疆野苹果NAC基因分析及抗腐烂病基因筛选

发布时间：2022-10-20 15:22

　　【目的】探明新疆野苹果（Malus sieversii）中NAC基因资源,筛选潜在的抗腐烂病NAC基因。【方法】以模式植物拟南芥（Arabidopsis thaliana）的NAC蛋白为种子构建隐马可夫模型,从新疆野苹果转录组数据库中鉴定NAC转录因子,利用Protparam及qRT-PCR等手段对其理化性质、亚细胞定位、保守基序、系统进化及腐烂病菌侵染后的表达谱进行分析。【结果】从新疆野苹果中鉴定到165个NAC基因,根据蛋白系统进化关系分为12个亚组,且MsNACs在各亚组间分布不均。蛋白理化性质分析结果表明,MsNACs大多属酸性,且多为亲水性蛋白。保守基序分析结果表明,大多数MsNAC转录因子拥有由7个保守基序组成的完整NAC结构域,少数存在亚结构域的缺失。膜结合域分析结果表明,有18个MsNACs蛋白具有膜结合域,且大多定位于细胞核,少数定位于内质网、线粒体等其他细胞器。表达分析结果表明,34个MsNACs在腐烂病菌侵染后差异表达,可根据表达模式分为A、B、C三个亚簇,其中MsNAC073和MsNAC102表达变化剧烈,分别在5 dpi下调近6倍和上调近140倍。【结论】基于... 

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料和方法
    1.1 材料及处理
    1.2 新疆野苹果NAC转录因子家族基因检索与鉴定
    1.3 新疆野苹果NAC转录因子蛋白质理化性质、膜结合域及亚细胞定位预测
    1.4 新疆野苹果NAC转录因子家族基因系统进化分析
    1.5 新疆野苹果NAC转录因子NAC结构域保守基序分析
    1.6 野苹果NAC转录因子家族基因在腐烂病胁迫下的基因表达特征分析
2 结果与分析
    2.1 新疆野苹果NAC转录因子的鉴定及理化性质分析
    2.2 新疆野苹果NAC转录因子家族系统进化分析
    2.3 新疆野苹果NAC家族蛋白保守基序的鉴定及分析
    2.4 新疆野苹果NAC转录因子的膜结合域分析
    2.5 新疆野苹果NAC转录因子家族基因腐烂病胁迫下的表达特征分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]划布轮法鉴定新疆野苹果树腐烂病抗性方法的建立[J]. 刘晓洁,李小双,张燕,梁玉青,周平,赵津艺,张道远.  西北农业学报. 2019(04)
[2]基于RNA-seq数据的生姜NAC转录因子家族鉴定及分析[J]. 廖钦洪,邹勇,李洪雷,姜玉松.  中国中药杂志. 2018(03)
[3]天山野苹果林苹果小吉丁与苹果腐烂病复合危害研究[J]. 刘爱华,张新平,温俊宝,岳朝阳,阿里木,焦淑萍,张静文,克热曼.  新疆农业科学. 2014(12)
[4]番茄NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析[J]. 陈秀玲,王傲雪,张珍珠,李景富.  植物生理学报. 2014(04)
[5]新疆野苹果和秦冠的抗黑星病特性[J]. 胡小平,张吉光,陈婧,周书涛,杨家荣,康振生.  植物病理学报. 2010(06)
[6]中国天山野果林种子植物组成及资源状况分析[J]. 羊海军,崔大方,许正,林培钧.  植物资源与环境学报. 2003(02)

硕士论文
[1]新疆野苹果（Malus sieversii）生物学特性和居群遗传多样性研究[D]. 杨美玲.天津农学院 2014



本文编号：3694788