落羽杉属种类及其杂交子代‘中山杉’系列品种的SSR指纹图谱构建及遗传关系分析
发布时间:2025-01-19 12:24
运用荧光标记毛细管电泳技术,对池杉[Taxodium distichum var.imbricatum(Nuttall) Croom]、墨西哥落羽杉(T.mucronatum Tenore)和落羽杉[T.distichum(Linn.) Rich.]的单株以及‘中山杉’(T.‘Zhongshanshan’)系列品种共96个样本进行SSR分子标记检测,分析供试样本的遗传多样性并分别构建指纹图谱;在此基础上,依据供试样本的Nei's遗传距离进行聚类分析。结果显示:6对SSR引物共扩增条带91条,其中多态性条带68条;每对引物扩增条带9~31条,其中多态性条带6~27条,多态性条带百分率平均值为70.9%;各引物的多态性信息含量指数为0.476~0.793,平均值为0.658;供试样本的Nei's基因多样性指数、Shannon's多态性信息指数、观测杂合度和期望杂合度的平均值分别为0.755、1.599、0.381和0.245。用4对SSR引物的多态性条带可构建40个‘中山杉’系列品种的指纹图谱,指纹编码数量为33,鉴别率达85.0%;用6对SSR引物的多态性条带可构建15个池杉、23个墨西...
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本文编号:4028975
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图1 40个‘中山杉’系列品种以及56个池杉、墨西哥落羽杉和落羽杉单株的NJ聚类图
SSR分子标记通常是共显性标记,呈共显性的引物有3种带型,即只有父本带、只有母本带和亲本杂合带[16-17]。本研究中,针对‘中山杉’系列品种进行SSR分子标记扩增,在排除信息错误后,其中有些品种的扩增条带出现了亲本中没有的新条带,例如:经四碱基(CCTT)5重复SSR引物TA0....
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