近海海域病原菌及水体中抗生素抗性基因与驱动因素研究

发布时间：2023-04-17 03:42

　　近年来,我国近海海域的污染情况逐渐加重,其中陆源污染为最主要的一种污染,因此陆源污染输入所带来的致病性微生物及抗生素抗性基因污染逐渐受到人们的重视。本文以秦皇岛滦河口海域和深圳大亚湾海域两个典型海域为研究对象,采用荧光定量PCR方法对近海水域较常出现的大肠杆菌、肠球菌和金黄色葡萄球菌的分布状况进行监测并分析其环境驱动因素,同时,采用宏基因组学结合荧光定量PCR方法对抗性基因的分布状况进行研究,得到了下列结果:对两海域环境因子的研究表明,滦河口海域环境因子在不同季节间差异显著,大亚湾海域环境因子仅冬季显著区别于其他三个季节。此外,两河口环境因子均呈现出随离岸距离增加而递减的趋势,但在养殖区会出现短暂上升。对两个海域病原菌分布特征的研究发现,不同季节滦河口海域和大亚湾海域中肠球菌和金黄色葡萄球菌的丰度存在显著差异,此外大亚湾海域的大肠杆菌丰度也表现出显著的季节性差异,差异最大可达10倍左右;在空间分布上,滦河口海域病原菌呈斑块状分布,大亚湾海域大肠杆菌和金黄色葡萄球菌从河口向中心逐渐递减,丰度最高可达1.30×10⁵和2.17×10⁶ copie...

【文章页数】：76 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 绪论
    1.1 研究近海病原菌及抗生素抗性基因的必要性
        1.1.1 病原菌造成的危害
        1.1.2 抗生素抗性基因(ARGs)的危害
    1.2 近海海域病原菌及抗性基因的研究现状
        1.2.1 病原菌概述及研究现状
        1.2.2 抗生素抗性基因概述及研究现状
    1.3 近海病原菌及ARGs检测技术
        1.3.1 病原菌常见检测方法
        1.3.2 ARGs常见检测方法
    1.4 研究海域背景
        1.4.1 秦皇岛滦河水质状况
        1.4.2 深圳大亚湾水质状况
    1.5 目的与意义
第2章 南北典型河口环境因子差异
    2.1 实验仪器与材料
        2.1.1 实验仪器
        2.1.2 实验材料
    2.2 实验方法
        2.2.1 样品的采集
        2.2.2 环境因子的测定
    2.3 实验结果与分析
        2.3.1 北方河口环境因子的时空分布
        2.3.2 南方河口环境因子的时空分布
        2.3.3 南北方河口主要环境因子差异
    2.4 小结
第3章 南北典型河口病原菌分布状况及驱动因素
    3.1 实验仪器与材料
        3.1.1 实验仪器
        3.1.2 实验材料
    3.2 实验方法
        3.2.1 环境样品DNA的提取
        3.2.2 目标菌种引物的设计
        3.2.3 质粒构建
        3.2.4 Quantitative -PCR法测定病原菌
    3.3 实验结果与分析
        3.3.1 秦皇岛滦河口病原菌时空分布特征
        3.3.2 北方滦河口病原菌变化的驱动因素
        3.3.3 深圳大亚湾病原菌时空分布特征
        3.3.4 南方大亚湾病原菌变化的驱动因素
        3.3.5 不同河口病原菌分布及驱动因素差异
    3.4 小结
第4章 不同生境下ARGs分布状况及其驱动因素
    4.1 实验仪器与材料
        4.1.1 实验仪器
        4.1.2 实验材料
    4.2 实验方法
        4.2.1 环境样品DNA的提取
        4.2.2 目标菌种引物的设计
        4.2.3 质粒构建
        4.2.4 Quantitative-PCR法测定抗性基因
        4.2.5 宏基因组学测定抗性基因
    4.3 实验结果与分析
        4.3.1 秦皇岛滦河口海域ARGs的时空分布特征
        4.3.2 驱动ARGs丰度变化的主要因素
        4.3.3 不同种类ARGs之间的关系
    4.4 小结
第5章 结论与展望
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
致谢



本文编号：3792494