利用InDel标记构建甘蓝型油菜的分子身份证
发布时间:2021-08-18 21:09
由于甘蓝型油菜品种数量的增多和品种间的遗传多样性水平较低,仅根据农艺性状对品种进行鉴别的难度逐渐增大。为准确快速地区分油菜品种,本研究从186个InDel标记中筛选出19个InDel标记,这19个In Del标记来自甘蓝型油菜的不同染色体上,并且每个InDel标记在品种(系)间均只有2种等位变异;通过对19个In Del标记在品种中的等位变异进行数字化赋值,构建了76份甘蓝型品种(系)和2份白菜型油菜品种的分子标记身份证。利用InDel标记构建甘蓝型油菜分子身份证的操作简便可行,并且品种(系)的标记信息数据更加简洁直观,有助于油菜品种资源的有效区分和利用,可以在油菜品种的纯合度鉴定、真实性鉴定和品种权益保护等方面提供帮助。
【文章来源】:分子植物育种. 2020,18(14)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
76份甘蓝型油菜和2份白菜型油菜的聚类
在甘蓝型油菜每条染色体上选取1个InDel标记,共选取19个InDel标记用于构建油菜的分子身份证。选取的InDel标记在品种(系)中的电泳图中仅有两条电泳条带,然后根据各InDel标记在品种中的分离进行赋值。赋值规则如下,每个InDel标记中仅含有较短的一种带型的品种赋值为“1”、仅含有较长一种带型的赋值为“2”、两种带型都有的品种赋值为“3”、两种带型均没有的品种赋值为“0”(图2)。每个品种中19个InDel标记的赋值参照其所在油菜染色体按从A01~A10,C01~C09的顺序排列,这样由“1”、“2”和“3”组成的19位数字串即为相应品种的分子身份证。作者贡献
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用[J]. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 棉花学报. 2019(04)
[2]基于InDel标记的大白菜育种材料分子身份证构建[J]. 刘栓桃,张志刚,王荣花,王立华,李巧云,赵智中. 中国蔬菜. 2019(02)
[3]基于InDel标记的国内绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建[J]. 李群三,陈景斌,顾和平,袁星星,陈新,崔瑾. 植物遗传资源学报. 2019(01)
[4]微卫星分子标记及其在动物遗传育种中的研究进展[J]. 杨万云,郑军军,贾博寅,常树卓,刘慧,李春义,王桂武,杨福合. 基因组学与应用生物学. 2017(11)
[5]利用SSR标记构建水稻核心亲本指纹图谱[J]. 曾晓珊,彭丹,石媛媛,谢伟,刘爱民. 作物研究. 2016(05)
[6]13个中国葡萄优新品种的分子身份证构建[J]. 王慧玲,闫爱玲,孙磊,张国军,王晓玥,徐海英. 生物技术通报. 2016(04)
[7]甘蓝型油菜育种亲本材料遗传多样性的SSR分析[J]. 何俊平,张书芬,王建平,文雁成,曹金华,蔡东芳,赵磊,朱家成. 西南农业学报. 2015(06)
[8]基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建[J]. 李国田,张美勇,相昆,徐颖,沈广宁,薛培生,杨军. 核农学报. 2015(10)
[9]油菜品种及高油育种材料遗传多样性SSR分析[J]. 李晓荣,张菁雯,赵燕妮,徐献锋,胡玉梅,于澄宇. 西北植物学报. 2015(02)
[10]北方地区白菜型冬油菜与春油菜的SSR和InDel遗传多样性分析[J]. 方彦,杨刚,孙万仓,王丽萍,张树娟,杨建胜,刘林波,刘自刚,曾秀存,武军艳. 中国油料作物学报. 2015(01)
本文编号:3350632
【文章来源】:分子植物育种. 2020,18(14)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
76份甘蓝型油菜和2份白菜型油菜的聚类
在甘蓝型油菜每条染色体上选取1个InDel标记,共选取19个InDel标记用于构建油菜的分子身份证。选取的InDel标记在品种(系)中的电泳图中仅有两条电泳条带,然后根据各InDel标记在品种中的分离进行赋值。赋值规则如下,每个InDel标记中仅含有较短的一种带型的品种赋值为“1”、仅含有较长一种带型的赋值为“2”、两种带型都有的品种赋值为“3”、两种带型均没有的品种赋值为“0”(图2)。每个品种中19个InDel标记的赋值参照其所在油菜染色体按从A01~A10,C01~C09的顺序排列,这样由“1”、“2”和“3”组成的19位数字串即为相应品种的分子身份证。作者贡献
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于高通量测序的棉花InDel标记开发及其应用[J]. 陆海燕,陈璐,王显生,赵涵,沈奇. 棉花学报. 2019(04)
[2]基于InDel标记的大白菜育种材料分子身份证构建[J]. 刘栓桃,张志刚,王荣花,王立华,李巧云,赵智中. 中国蔬菜. 2019(02)
[3]基于InDel标记的国内绿豆品种遗传多样性分析及指纹图谱构建[J]. 李群三,陈景斌,顾和平,袁星星,陈新,崔瑾. 植物遗传资源学报. 2019(01)
[4]微卫星分子标记及其在动物遗传育种中的研究进展[J]. 杨万云,郑军军,贾博寅,常树卓,刘慧,李春义,王桂武,杨福合. 基因组学与应用生物学. 2017(11)
[5]利用SSR标记构建水稻核心亲本指纹图谱[J]. 曾晓珊,彭丹,石媛媛,谢伟,刘爱民. 作物研究. 2016(05)
[6]13个中国葡萄优新品种的分子身份证构建[J]. 王慧玲,闫爱玲,孙磊,张国军,王晓玥,徐海英. 生物技术通报. 2016(04)
[7]甘蓝型油菜育种亲本材料遗传多样性的SSR分析[J]. 何俊平,张书芬,王建平,文雁成,曹金华,蔡东芳,赵磊,朱家成. 西南农业学报. 2015(06)
[8]基于ISSR标记的16个核桃品种遗传多样性分析及分子身份构建[J]. 李国田,张美勇,相昆,徐颖,沈广宁,薛培生,杨军. 核农学报. 2015(10)
[9]油菜品种及高油育种材料遗传多样性SSR分析[J]. 李晓荣,张菁雯,赵燕妮,徐献锋,胡玉梅,于澄宇. 西北植物学报. 2015(02)
[10]北方地区白菜型冬油菜与春油菜的SSR和InDel遗传多样性分析[J]. 方彦,杨刚,孙万仓,王丽萍,张树娟,杨建胜,刘林波,刘自刚,曾秀存,武军艳. 中国油料作物学报. 2015(01)
本文编号:3350632
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