不同产地南药益智的AFLP分析

发布时间：2021-08-21 07:44

　　目的通过对AFLP分子标记的引物筛选和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行优化和分析,获得一套适用于南药益智的AFLP技术体系。方法采用8对引物随机配对形成64对引物,以不同产地的益智基因组DNA为模板进行AFLP-PCR扩增,再利用聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,筛选能够鉴定益智遗传多样性的核心引物,进一步采用NTSYS软件进行聚类分析。结果从64对引物中筛选了4对引物适合于益智AFLP分析,并以E3/M7引物组合效果最佳,扩增出104条多态性带,多态性带比率为94.54%,能够鉴定不同产地益智的种质资源。结论获得适合分析不同产地益智的AFLP技术体系,为研究南药益智遗传多样性奠定基础。 

【文章来源】：时珍国医国药. 2020,31(05)北大核心CSCD

【文章页数】：3 页

【部分图文】：

不同产地的益智基因组DNA的电泳图

酶切片段与连接引物连接后作为模板,经预扩增和选择性扩增获得PCR产物经琼脂糖电泳分析。其中以E3/M8、E1/M8、E2/M4、E3/M7为选择性扩增引物的PCR扩增的结果如图2,扩增产物片段大小绝大部分在750bp以下,片段大小比较适合。但琼脂糖电泳分辨率较低,条带均呈分散均匀且连续成一片的弥散带,需要进行下一步的聚丙烯酰胺电泳。3.3 聚丙烯酰胺电泳分析

选择性扩增产物经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显色后的结果如图3。以引物组合E3/M7的扩增条带信号最好,且分布均匀,能够找到稳定,清晰,分辨率高的指纹谱带。我们统计全部清晰、可分辩的条带,E3/M7,E1/M8,E3/M8和E2/M4引物组合扩增产物所得总条带数分别为110,27,36和68,多态性带条带数分别为104,24,34和64,多态性百分率分别为94.54%,88.89%,94.44%和94.11%(表3)。3.4 聚类分析

【参考文献】：
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本文编号：3355183