白羊草NAC转录因子家族生物信息学分析

发布时间：2021-09-04 08:50

　　NAC转录因子家族是植物特有的一类重要转录因子,广泛参与植物生长、发育以及器官的建成、逆境胁迫应答等过程。为进一步研究白羊草（Bothriochloa ischaemum）NAC转录因子家族,本研究利用生物信息学方法对白羊草NAC基因所编码的蛋白理化性质、二级结构、保守基序、亚细胞定位、潜在磷酸化位点及系统进化关系进行了分析。结果显示,具有NAC结构域的21条白羊草氨基酸序列共分为10个亚家族,蛋白二级结构以无规则卷曲为主要组成部分,含有5个保守基序,大多数NAC蛋白定位于细胞核,均含有潜在的丝氨酸（Ser）、苏氨酸（Thr）、和酪氨酸（Tyr）磷酸化位点。本研究将为白羊草NAC基因家族的进一步功能分析奠定重要的研究基础。 

【文章来源】：草地学报. 2020,28(05)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

白羊草NAC基因家族成员的系统进化分析

从理化性质分析结果中发现(表1),白羊草NAC蛋白序列的平均长度为363个氨基酸,平均分子量为40.07 kDa,其中白羊草NAC转录因子家族中蛋白分子量最大的蛋白为BiNAC18,编码673个氨基酸,相对分子量为75.92 kDa,分子量最小的蛋白为BiNAC10,编码141个氨基酸,相对分子量为16.97 kDa。白羊草NAC基因家族蛋白包含酸性蛋白12个,碱性蛋白9个,其中BiNAC5的碱性最强(10.79),BiNAC8的酸性最强(4.4);从白羊草NAC蛋白的亲水性预测结果可以看出,21个NAC蛋白的亲水性平均系数均为负值,说明它们都是亲水性蛋白,只是在亲水的程度上存在着差异,其中两性氨基酸的数量为9个,分别为BiNAC1(-0.497)、BiNAC2(-0.438)、BiNAC7(-0.402)、BiNAC8(-0.452)、BiNAC14(-0.377)、BiNAC16(-0.409)、BiNAC18(-0.439)、BiNAC19(-0.207)、BiNAC20(-0.464)。蛋白的不稳定指数>40即为不稳定蛋白质,白羊草NAC转录因子家族中有4个稳定性蛋白,17个不稳定蛋白。2.4 白羊草NAC转录因子家族基因蛋白质的磷酸化修饰位点的预测分析

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3382957