东方山羊豆种质资源ISSR分析
发布时间:2021-10-21 21:53
【目的】分析东方山羊豆种质资源遗传多样性,为其种质资源鉴定评价、新品种选育及开发利用提供理论参考。【方法】以4份引进东方山羊豆种质及其29份杂交后代为材料,利用ISSR引物对其进行多态性扩增,并以PopGene32计算其遗传参数,采用NTsys-pc 2.1计算遗传相似系数,运用SHAN模型中的非加权配对算术平均法(UPGMA)绘制聚类树状图。【结果】从24条ISSR引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性良好且易扩增的引物,利用其从33份东方山羊豆种质材料中共扩增出79条条带,其中65条具有多态性,多态百分率为82.15%;观察等位基因数(Na)为1.6667~2.0000,平均为1.8215,有效等位基因数(Ne)为1.2212~1.5740,平均为1.4242;Nei’基因多样性指数(H)为0.1521~0.3322,平均为0.2509,Shannon多态信息指数(I)为0.2473~0.4976,平均为0.3813。这些种质材料遗传相似系数为0.5696~0.9241,平均为0.7623,在0.7140处可划分为三大类群(Ⅰ~Ⅲ),分别包含25、3和5份种质材料,不同地理来源种质相...
【文章来源】:南方农业学报. 2020,51(11)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
33份东方山羊豆种质材料基因组DNA的检测结果
引物834对33份东方山羊豆种质材料的PCR扩增结果
通过UPGMA法对33份供试材料的ISSR多态性进行聚类分析,结果如图4所示。33份东方山羊豆种质资源在遗传相似系数0.7140处可分为三大类群(Ⅰ~Ⅲ)。第Ⅰ类群包括25份种质,其在遗传相似系数0.7260处又可分为2个亚群Ⅰ-1和Ⅰ-2:Ⅰ-1亚类包括23份种质,其中GY07号白花(编号7)、ZNK18(编号26)、GYN18(编号29)和GYP18(编号30)与其他19份种质的遗传相似系数介于0.7380~0.7500,说明其亲缘关系较远,遗传多样性较丰富;进一步分析发现,在这19份种质中,GY04号白花(编号4)与GY05号白花(编号5)种质间的亲缘关系最近,遗传差异最小,其余17份种质中位于同一小分支种质的亲缘关系较近,遗传多样性较低,如ZNH18(编号23)与GYI18(编号24)二者间、ZNE18(编号22)、ZN小叶(编号20)和GY大叶(编号19)三者间等。Ⅰ-2亚群包括GY08号白花(编号8)和GY17号白花(编号15)2份种质,二者的遗传相似系数为0.7342,说明其亲缘关系较远,存在一定的遗传差异。第Ⅱ类群包括GY10号白花(编号10)、GY16号白花(编号14)和GYD18白花(编号16)3份种质。第Ⅲ类群包括GYJ18(编号25)、GYM18(编号28)、GYQ18(编号31)、GYS18(编号33)和GYR18(编号32)等5份种质,其中GYR18与另外4份遗传相似系数介于0.7140~0.7260,说明其亲缘关系较远,遗传差异较大,遗传多样性较丰富。综上所述,不同地理来源种质相互混杂分布,种质资源间遗传分布与地理来源间无明显相关性,第Ⅱ类群和第Ⅲ类群东方山羊豆种质材料间遗传多样性较第Ⅰ类群丰富。3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]斑茅野生种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 徐荣,何丽莲,王先宏,陈疏影,杨清辉,张汉尧,李富生. 分子植物育种. 2017(07)
[2]37份山羊豆种质资源的遗传多样性SSR分析[J]. 尹淑英,Vladimir F.Chapurin,Nickolay I.Dzyubenko,高洪文,王赞. 中国草地学报. 2016(06)
[3]20个紫花苜蓿品种的ISSR遗传多样性分析[J]. 李杉杉,毛培春,郭静雅,郭强,田小霞,孟林. 草原与草坪. 2016(04)
[4]东方山羊豆种质资源遗传多样性ISSR分析[J]. 余国辉,王赞,王俊娥,刘海泉,高洪文,Nikolay Dzyubenko,Vladimir Chapurin,呼天明. 中国草地学报. 2014(03)
[5]ISSR分子标记技术在植物种质资源研究中的应用[J]. 朱岩芳,祝水金,李永平,马文广,郑昀晔,胡晋. 种子. 2010(02)
[6]ISSR分子标记及其应用[J]. 罗海燕,陈业渊. 安徽农学通报. 2008(19)
[7]山羊豆种质资源形态多样性分析[J]. 王俊娥,王赞,王运琦,高洪文,Vladimir Chapurin. 植物遗传资源学报. 2008(02)
[8]盐胁迫对东方山羊豆生理特性的影响[J]. 沙伟,侯云杰,罗新义. 北方园艺. 2008(04)
[9]PEG胁迫下东方山羊豆抗旱生理特性的研究[J]. 郝伟伟,师帅,禤丽芳,沙伟. 齐齐哈尔大学学报. 2008(02)
[10]野牛草实生群体多样性的表型及ISSR分析[J]. 刘莉,邓春婷,包满珠. 草业科学. 2008(01)
本文编号:3449782
【文章来源】:南方农业学报. 2020,51(11)北大核心CSCD
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
33份东方山羊豆种质材料基因组DNA的检测结果
引物834对33份东方山羊豆种质材料的PCR扩增结果
通过UPGMA法对33份供试材料的ISSR多态性进行聚类分析,结果如图4所示。33份东方山羊豆种质资源在遗传相似系数0.7140处可分为三大类群(Ⅰ~Ⅲ)。第Ⅰ类群包括25份种质,其在遗传相似系数0.7260处又可分为2个亚群Ⅰ-1和Ⅰ-2:Ⅰ-1亚类包括23份种质,其中GY07号白花(编号7)、ZNK18(编号26)、GYN18(编号29)和GYP18(编号30)与其他19份种质的遗传相似系数介于0.7380~0.7500,说明其亲缘关系较远,遗传多样性较丰富;进一步分析发现,在这19份种质中,GY04号白花(编号4)与GY05号白花(编号5)种质间的亲缘关系最近,遗传差异最小,其余17份种质中位于同一小分支种质的亲缘关系较近,遗传多样性较低,如ZNH18(编号23)与GYI18(编号24)二者间、ZNE18(编号22)、ZN小叶(编号20)和GY大叶(编号19)三者间等。Ⅰ-2亚群包括GY08号白花(编号8)和GY17号白花(编号15)2份种质,二者的遗传相似系数为0.7342,说明其亲缘关系较远,存在一定的遗传差异。第Ⅱ类群包括GY10号白花(编号10)、GY16号白花(编号14)和GYD18白花(编号16)3份种质。第Ⅲ类群包括GYJ18(编号25)、GYM18(编号28)、GYQ18(编号31)、GYS18(编号33)和GYR18(编号32)等5份种质,其中GYR18与另外4份遗传相似系数介于0.7140~0.7260,说明其亲缘关系较远,遗传差异较大,遗传多样性较丰富。综上所述,不同地理来源种质相互混杂分布,种质资源间遗传分布与地理来源间无明显相关性,第Ⅱ类群和第Ⅲ类群东方山羊豆种质材料间遗传多样性较第Ⅰ类群丰富。3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]斑茅野生种质资源遗传多样性的ISSR分析[J]. 徐荣,何丽莲,王先宏,陈疏影,杨清辉,张汉尧,李富生. 分子植物育种. 2017(07)
[2]37份山羊豆种质资源的遗传多样性SSR分析[J]. 尹淑英,Vladimir F.Chapurin,Nickolay I.Dzyubenko,高洪文,王赞. 中国草地学报. 2016(06)
[3]20个紫花苜蓿品种的ISSR遗传多样性分析[J]. 李杉杉,毛培春,郭静雅,郭强,田小霞,孟林. 草原与草坪. 2016(04)
[4]东方山羊豆种质资源遗传多样性ISSR分析[J]. 余国辉,王赞,王俊娥,刘海泉,高洪文,Nikolay Dzyubenko,Vladimir Chapurin,呼天明. 中国草地学报. 2014(03)
[5]ISSR分子标记技术在植物种质资源研究中的应用[J]. 朱岩芳,祝水金,李永平,马文广,郑昀晔,胡晋. 种子. 2010(02)
[6]ISSR分子标记及其应用[J]. 罗海燕,陈业渊. 安徽农学通报. 2008(19)
[7]山羊豆种质资源形态多样性分析[J]. 王俊娥,王赞,王运琦,高洪文,Vladimir Chapurin. 植物遗传资源学报. 2008(02)
[8]盐胁迫对东方山羊豆生理特性的影响[J]. 沙伟,侯云杰,罗新义. 北方园艺. 2008(04)
[9]PEG胁迫下东方山羊豆抗旱生理特性的研究[J]. 郝伟伟,师帅,禤丽芳,沙伟. 齐齐哈尔大学学报. 2008(02)
[10]野牛草实生群体多样性的表型及ISSR分析[J]. 刘莉,邓春婷,包满珠. 草业科学. 2008(01)
本文编号:3449782
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