基于高通量测序的金钗石斛种子内生菌群落结构组成分析

发布时间：2021-11-07 08:52

　　本研究基于免培养和高通量测序技术,对金钗石斛种子内生菌16 S rDNA V 4区和ITS 1区扩增序列进行分析,揭示内生菌的组成和丰度。结果表明:扩增的内生细菌16 S rDNA序列归为13 OTUs,隶属于变形菌门（Proteobacteria）和蓝细菌门（Cyanobacteria）;其中变形菌门为优势门,泛菌属（Pantoea）为优势属;香农指数、辛普森指数和Chao 1指数分别为1.82、0.69和11.00。内生真菌序列归为14个OTUs,隶属于子囊菌门（Ascomycota）、担子菌门（Basidiomycota）和接合菌门（Zygomycota）;其中子囊菌门为优势门,德巴利酵母属（Debaryomyces）为优势属;香农指数、辛普森指数和Chao1指数分别为0.57、0.79和14.13。金钗石斛种子的内生细菌与内生真菌具有一定的多样性。此研究为进一步促进金钗石斛种子萌发及幼苗栽培具有一定的指导意义。 

【文章来源】：种子. 2020,39(08)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

种子内生细菌门水平和属水平丰度分布

金钗石斛种子内生真菌隶属于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota),分别占内生真菌的97.04%、2.84%和0.12%(图2)。子囊菌门分属于4个纲,6个目,10个科,5个属。酵母纲(Saccharomycetes)占88.75%,包括1个OTU,为酵母目(Saccharomycetales)、分类未定科(Incertae sedis Saccharomycetales)德巴利酵母属(Debaryomyces)。座囊菌纲(Dothideomycetes)有4个OTUs(1.61%),格孢腔菌目(Pleosporales)占1.36%,包括格孢菌科(Pleosporaceae)链格孢属(Alternaria),占0.74%,以及未分类的格孢腔菌目(Incertae sedis Pleosporales),占0.62%。散囊菌纲(Eurotiomycetes)有2个OTUs(1.24%),包括散囊菌目(Eurotiales)发菌科(Trichocomaceae),占0.99%;以及刺盾炱目(Chaetothyriales)毛蕊科(Herpotrichiellaceae),0.25%,属水平分类未定。锤舌菌纲(Leotiomycetes)有1个OTU(0.25%),为柔膜菌目(Helotiales)石竹科(Rutstroemiaceae)蜡盘菌属(Rutstroemia)。另外,子囊菌门真菌在纲水平占5.19%(1个OTU)和属水平占7.29%分类未定划入Others。

【参考文献】：
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本文编号：3481553