基于比较转录组的夏枯草组织差异表达分析

发布时间：2022-01-01 06:01

　　目的分析夏枯草Prunella vulgaris果穗、茎、叶片转录组,挖掘夏枯草次生代谢产物生物合成的功能及调节基因。方法利用Illumina高通量测序技术对夏枯草不同组织进行转录组测序,并从差异表达的基因中鉴定次生代谢物生物合成的相关酶基因。结果在夏枯草的3个不同组织的转录本中,共有8 270个Unigenes在至少2个样品间差异显著。对不同组织差异表达的基因进行KEGG富集分析,结果表明,不同组织中苯丙素类生物合成的基因表达均有较大的变化。在夏枯草差异基因中分别搜索三萜类和酚酸类生物合成途径的关键酶,共鉴定到31个三萜类生物合成相关的Unigene,16个酚酸类生物合成相关的Unigenes,113个P450相关的Unigenes。结论本研究为后续发掘夏枯草次生物质代谢合成途径相关功能基因提供依据,也为夏枯草次生代谢物的生物合成调控研究奠定基础。 

【文章来源】：中草药. 2020,51(13)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

夏枯草三萜类(A)和酚酸类(B)成分生物合成相关差异表达基因聚类分析

对识别到的差异表达基因进行功能注释，各差异表达基因集注释到的基因数量统计结果见表2，在果穗和叶、果穗和茎、叶和茎之间的差异表达基因集中，分别有4 837(79.72%）、4 396(80.10%）、3 771(80.54%）个Unigenes被Nr数据库注释。3.3 差异表达基因KEGG代谢通路富集分析

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
[1]夏枯草迷迭香酸生物合成途径酪氨酸支路关键酶基因的克隆与功能研究[D]. 汝梅.中国科学院教育部水土保持与生态环境研究中心 2017



本文编号：3561763