鉴别紫芝菌株的PCR引物筛选及其序列比对验证

发布时间：2022-01-12 06:24

　　【目的】紫芝S2（品种名:武芝2号）是近年来在福建及周边省份推广应用的紫芝栽培新品种,为了避免与遗传背景不同的栽培菌株混杂而建立有效的分子标记。【方法】采用PCR扩增筛选条带清晰稳定、呈现多态性的引物,根据菌株间UPMGA聚类构建系统发生树,通过遗传距离确定主要栽培菌株间的亲缘关系,并与菌株间的拮抗反应结果相映证,进而与‘紫芝S2’基因组序列进行比对验证。【结果】筛选得到能清晰且稳定地扩增出特异性或多态性条带的2个RAPD-PCR引物和3个ISSR-PCR引物,比对发现这5个引物短序列与‘紫芝S2’基因组序列完全匹配上的位点与数目不同。【结论】基于紫芝S2基因组序列比对,确认其中3个引物（ISSR13、 S1326和S1506）可以有效地用于紫芝栽培菌株鉴定。 

【文章来源】：福建农业学报. 2020,35(07)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

紫芝菌株间的拮抗现象

RAPD-PCR扩增图谱

紫芝菌株的遗传聚类图

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]RAPD、SRAP和ISSR标记在香菇种质资源的应用及其SCAR标记的建立[D]. 应正河.福建农林大学 2006



本文编号：3584275