马蓝邻氨基苯甲酸合成酶基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2022-02-24 00:31

　　邻氨基苯甲酸合成酶（AS）由α亚基和β亚基组成,是存在于植物细胞中催化生成色氨酸的复合酶。本研究采用RT-PCR技术,从野生马蓝中克隆得到一个编码邻氨基苯甲酸合成酶α亚基同源基因的cDNA片段,命名为BcASA （GenBank登录号:MH976794）。序列分析表明,该cDNA片段全长1 110 bp,利用NCBI ORF Finder预测显示包含一个915 bp的开放阅读框,预测编码一条含370个氨基酸的多肽,分子量约为41.29 kD,理论等电点为9.38。生物信息学分析表明,BcASA属于定位在叶绿体中的亲水性蛋白,二级结构主要为α螺旋。系统发育分析表明,野生马蓝BcASA蛋白与芝麻的AS在进化上种属关系最近。本研究结果可为研究邻氨基苯甲酸合成酶在催化马蓝有效成分形成过程中的作用及其代谢调控提供实验依据。 

【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(12)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 马蓝Bc ASA蛋白基因的克隆
    1.2 Bc ASA蛋白生物信息学分析
        1.2.1 Bc ASA蛋白理化性质分析
        1.2.2 亲疏水性分析
        1.2.3 跨膜结构和信号肽预测
        1.2.4 亚细胞定位预测
        1.2.5 二级结构预测
        1.2.6 氨基酸磷酸化位点预测
        1.2.7 三级结构预测
        1.2.8 Bc ASA保守结构域预测
        1.2.9 Bc ASA氨基酸序列同源性比对和系统发育树的构建
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 材料
    3.2 RNA的提取和c DNA第一链的合成
    3.3 引物设计
    3.4 生物信息学分析
作者贡献


【参考文献】：
期刊论文
[1]微生物莽草酸代谢途径的研究进展[J]. 陈园,赵淑娟.  江苏农业科学. 2019(07)
[2]β-葡萄糖苷酶Bgl2238生物信息学分析[J]. 黄庆,唐乐丽,王晓萌,范新炯,李荷.  基因组学与应用生物学. 2018(04)
[3]马蓝种质资源研究进展[J]. 周正,郭志英,谭何新,刘佳颖,刁勇,张磊.  药学实践杂志. 2017(01)
[4]马蓝次生代谢产物研究进展[J]. 曾美娟,刁勇.  中国农学通报. 2016(20)
[5]植物中邻氨基苯甲酸合成酶的研究进展[J]. 钱旭,于可济,袁冠绅,杨航宇,潘秋红,朱保庆.  热带生物学报. 2015(04)



本文编号：3641605