非生物胁迫下蒙古黄芪与碱蓬基因组MSAP对比分析
发布时间：2022-02-26 22:07
本研究对比分析了珍惜中药材蒙古黄芪与碱蓬基因组的DNA甲基化之间的关系。挑选内蒙古等地区的非生物胁迫因素——高盐,以蒙古黄芪和碱蓬培养7 d苗龄幼苗为前期材料,利用NaCl模拟不同程度的高盐胁迫,提取二者的DNA后进行基因组的甲基化分析,分别研究高盐胁迫下DNA甲基化程度的变化。结果显示,与正常生长下的蒙古黄芪和碱蓬基因组相比,蒙古黄芪DNA甲基化程度随盐浓度增加,MSAP比例从大到小在51.2%～35.3%之间变化;碱蓬DNA甲基化程度随盐浓度增加,MSAP比例从大到小在68.4%～56.8%之间变化。说明蒙古黄芪和碱蓬DNA甲基化的MSAP比率随盐浓度增加呈下降趋势,与胁迫呈显著负相关。且古黄芪MSAP的下降趋势更加明显,由此假设,由于盐生碱蓬属耐盐性植物,自身具有良好的抗盐机制,因此,与蒙古黄芪比较,盐胁迫下,碱蓬某些抗盐基因更易被启动,进一步论证发现盐胁迫引起的低甲基化与抗盐基因表达之间存在一定的关系。
【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(12)北大核心CSCD
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
碱蓬和蒙古黄芪DNA的提取及其1.5%琼脂糖凝胶电泳检测
图1 碱蓬和蒙古黄芪DNA的提取及其1.5%琼脂糖凝胶电泳检测结果与正常生长下的蒙古黄芪和碱蓬基因组相比，蒙古黄芪，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在51.2%～35.3%之间变化；碱蓬，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在68.4%～56.8%之间变化。两种材料都出现随盐浓度升高，MSAP比率呈下降趋势。这个结论与以下结论类似，李雪林等(2009)研究表明棉花经梯度盐浓度处理后，DNA甲基化比率均低于对照41.2%；孙丽芳等(2017)研究表明玉米经梯度盐浓度处理后，其中只有50 mmol/L Na Cl处理高于CK，其他处理呈下降趋势，去甲基化变化幅度相对较大。
结果与正常生长下的蒙古黄芪和碱蓬基因组相比，蒙古黄芪，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在51.2%～35.3%之间变化；碱蓬，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在68.4%～56.8%之间变化。两种材料都出现随盐浓度升高，MSAP比率呈下降趋势。这个结论与以下结论类似，李雪林等(2009)研究表明棉花经梯度盐浓度处理后，DNA甲基化比率均低于对照41.2%；孙丽芳等(2017)研究表明玉米经梯度盐浓度处理后，其中只有50 mmol/L Na Cl处理高于CK，其他处理呈下降趋势，去甲基化变化幅度相对较大。图4 碱蓬DNA甲基化随盐浓度变化曲线
【参考文献】：
期刊论文
[1]非生物胁迫蒙古黄芪基因组的MSAP分析[J]. 韩雅楠,赵犇鹏,崔向军. 基因组学与应用生物学. 2020(07)
[2]盐胁迫诱导玉米苗期DNA甲基化变异的研究[J]. 孙丽芳,胡凯凤,高树仁,王霞,赵伟,苗兴芬,杨克军. 核农学报. 2017(04)
[3]黄芪生物学及化学成分研究进展[J]. 王玲丽,丰华玲,杨柯,滕红梅,胡正海. 基因组学与应用生物学. 2017(06)
[4]NaCl和Na2CO3对不同棉花基因组的DNA甲基化影响[J]. 陆许可,王德龙,阴祖军,王俊娟,樊伟丽,王帅,赵小洁,张天豹,叶武威. 中国农业科学. 2014(16)
[5]盐胁迫对菘蓝基因组DNA甲基化的影响[J]. 杨飞,聂浩,徐延浩. 中药材. 2013(04)
[6]利用MSAP分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性[J]. 史卫东,黄如葵,陈振东,罗海玲,康红卫,梁家作,刘杏连. 基因组学与应用生物学. 2012(05)
[7]盐胁迫下红花基因组DNA甲基化的MSAP分析[J]. 李慧,彭立新,于玮玮,冯涛,林木强,阎国荣. 西北农业学报. 2011(12)
[8]碱蓬资源的开发价值[J]. 任伟重,姜华,郑音,修玉萍. 辽宁农业科学. 2011(05)
[9]NaCl胁迫下碱蓬基因组MSAP分析[J]. 赵秀娟,韩雅楠,蔡禄. 湖北农业科学. 2011(18)
[10]盐胁迫下棉花基因组DNA表观遗传变化的MSAP分析[J]. 李雪林,林忠旭,聂以春,郭小平,张献龙. 作物学报. 2009(04)
硕士论文
[1]NaCl胁迫下蒙古黄芪和碱蓬基因组DNA甲基化水平分析[D]. 韩雅楠.内蒙古科技大学 2011
[2]水稻胚性愈伤组织诱导和植株再生伴随DNA胞嘧啶甲基化的减少和恢复[D]. 苗高健.东北师范大学 2009
本文编号：3645067
【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(12)北大核心CSCD
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
碱蓬和蒙古黄芪DNA的提取及其1.5%琼脂糖凝胶电泳检测
图1 碱蓬和蒙古黄芪DNA的提取及其1.5%琼脂糖凝胶电泳检测结果与正常生长下的蒙古黄芪和碱蓬基因组相比，蒙古黄芪，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在51.2%～35.3%之间变化；碱蓬，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在68.4%～56.8%之间变化。两种材料都出现随盐浓度升高，MSAP比率呈下降趋势。这个结论与以下结论类似，李雪林等(2009)研究表明棉花经梯度盐浓度处理后，DNA甲基化比率均低于对照41.2%；孙丽芳等(2017)研究表明玉米经梯度盐浓度处理后，其中只有50 mmol/L Na Cl处理高于CK，其他处理呈下降趋势，去甲基化变化幅度相对较大。
结果与正常生长下的蒙古黄芪和碱蓬基因组相比，蒙古黄芪，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在51.2%～35.3%之间变化；碱蓬，DNA甲基化程度随盐浓度增加，MSAP比例从大到小在68.4%～56.8%之间变化。两种材料都出现随盐浓度升高，MSAP比率呈下降趋势。这个结论与以下结论类似，李雪林等(2009)研究表明棉花经梯度盐浓度处理后，DNA甲基化比率均低于对照41.2%；孙丽芳等(2017)研究表明玉米经梯度盐浓度处理后，其中只有50 mmol/L Na Cl处理高于CK，其他处理呈下降趋势，去甲基化变化幅度相对较大。图4 碱蓬DNA甲基化随盐浓度变化曲线
【参考文献】：
期刊论文
[1]非生物胁迫蒙古黄芪基因组的MSAP分析[J]. 韩雅楠,赵犇鹏,崔向军. 基因组学与应用生物学. 2020(07)
[2]盐胁迫诱导玉米苗期DNA甲基化变异的研究[J]. 孙丽芳,胡凯凤,高树仁,王霞,赵伟,苗兴芬,杨克军. 核农学报. 2017(04)
[3]黄芪生物学及化学成分研究进展[J]. 王玲丽,丰华玲,杨柯,滕红梅,胡正海. 基因组学与应用生物学. 2017(06)
[4]NaCl和Na2CO3对不同棉花基因组的DNA甲基化影响[J]. 陆许可,王德龙,阴祖军,王俊娟,樊伟丽,王帅,赵小洁,张天豹,叶武威. 中国农业科学. 2014(16)
[5]盐胁迫对菘蓝基因组DNA甲基化的影响[J]. 杨飞,聂浩,徐延浩. 中药材. 2013(04)
[6]利用MSAP分析18个芥蓝齐口期的表观遗传多样性[J]. 史卫东,黄如葵,陈振东,罗海玲,康红卫,梁家作,刘杏连. 基因组学与应用生物学. 2012(05)
[7]盐胁迫下红花基因组DNA甲基化的MSAP分析[J]. 李慧,彭立新,于玮玮,冯涛,林木强,阎国荣. 西北农业学报. 2011(12)
[8]碱蓬资源的开发价值[J]. 任伟重,姜华,郑音,修玉萍. 辽宁农业科学. 2011(05)
[9]NaCl胁迫下碱蓬基因组MSAP分析[J]. 赵秀娟,韩雅楠,蔡禄. 湖北农业科学. 2011(18)
[10]盐胁迫下棉花基因组DNA表观遗传变化的MSAP分析[J]. 李雪林,林忠旭,聂以春,郭小平,张献龙. 作物学报. 2009(04)
硕士论文
[1]NaCl胁迫下蒙古黄芪和碱蓬基因组DNA甲基化水平分析[D]. 韩雅楠.内蒙古科技大学 2011
[2]水稻胚性愈伤组织诱导和植株再生伴随DNA胞嘧啶甲基化的减少和恢复[D]. 苗高健.东北师范大学 2009
本文编号：3645067
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