基于SSR分子标记的枸杞遗传多样性研究

发布时间：2023-03-17 13:39

　　【目的】使用黑果枸杞的转录组数据开发适合枸杞的EST-SSR引物,用于分析评价枸杞品种和种质的遗传多样性,为黑果枸杞种质资源评价和新品种培育提供理论依据。【方法】基于NCBI公共数据库已经发表的黑果枸杞果实转录组数据,分析得到枸杞的EST-SSR分子标记,合成了符合设计标准的182对EST-SSR引物,经过扩增和多态性筛选后,将多态性好的引物用于30份枸杞材料的遗传多样性分析。【结果】在182对引物中,有176对引物可以扩增出条带,共筛选出20对多态性好、有特异性的引物,其多数引物扩增条带数为2～8条。使用20对引物在30份枸杞材料中共扩增得到121条条带,平均每对引物扩增出6.05条,有效等位基因数(N_e)的均值为1.473 1个,Nei’s多样性指数(H)的均值为0.291 7,Shannon信息指数(I)的均值为0.451 7,多态性信息含量(PIC)均值为0.667,30份材料的遗传相似系数为0.459 2～0.991 8,表明品种间具有较丰富的遗传差异。聚类分析结果表明,30份枸杞材料被分为6个组,黑果枸杞与红果枸杞明显归于不同类型,不同种源地的黑果枸杞...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 基因组DNA的提取
        1.2.2 转录组数据处理及引物设计
        1.2.3 引物的筛选
        1.2.4 SSR-PCR反应体系
        1.2.5 PCR产物的检测
    1.3 数据处理
2 结果与分析
    2.1 SSR引物扩增结果分析
    2.2 遗传相似性与聚类分析
3 结论与讨论



本文编号：3763220