EST-SSR构建益母草栽培种指纹图谱及遗传多样性

发布时间：2024-02-19 10:32

　　为了对益母草品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,试验采用EST-SSR (Expressed Sequence Tag-Simple Sequence Repeats)分子标记技术构建了生产上常用的10个益母草栽培品种的数字指纹图谱及遗传多样性分析。试验共筛选出13对益母草EST-SSR分子标记,检测等位位点61个,其中含多态性位点52个,多态性比率为85.2%。EST-SSR引物扩增2～11个等位位点,平均每对引物扩增4.69个基因型,扩增条带100～600 bp,多态信息含量(PIC) 0.551,基因流(Nm) 1.319,平均杂合率0.647。从13对引物中,筛选出5对核心引物,即LJ17、LJ21、LJ29、LJ47和LJ62,以引物组合方式构建指纹图谱可区分10个品种;聚类分析表明在遗传距离0.66处10个品种被分为3类,聚类结果与品种的来源具有较高的一致性。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 叶片的碱处理
    1.3 EST-SSR PCR扩增
    1.4 数据处理
2 结果与分析
    2.1 EST-SSR引物扩增
    2.2 EST-SSR指纹图谱的构建
    2.3 聚类分析
3 讨论



本文编号：3902549