草莓抗白粉病RPW8同源基因的序列特征分析

发布时间：2022-01-23 10:54

　　利用草莓基因组数据鉴定出15个草莓RPW8同源基因（FaRPW8.1,FaRPW8.2-1～14）,它们之间的碱基比例差异较小,但编码蛋白的相对分子量相差较大,范围为14734.20～196956.90Da,理论等电点5.05～8.52,不稳定性指数范围39.35～53.50,脂肪族指数介于93.19～108.68之间,氨基酸组成中以亮氨酸（Leu）和赖氨酸（Lys）为主。保守结构域分析结果显示草莓RPW8同源基因含有1～4个结构域,其中RPW8为特征结构域。系统进化分析显示,FaRPW8.2-12和FaRPW8.2-13同谷子、小麦、水稻RPW8聚为一类,FaRPW8.2-3与番茄、蜜柑、橙子等RPW8基因聚为一类,其余12个草莓RPW8基因同源基因与其它物种的亲缘关系较远,单独聚为一类。研究结果可为草莓抗病育种提供理论依据。 

【文章来源】：唐山师范学院学报. 2020,42(06)

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【部分图文】：

草莓RPW8同源基因编码蛋白的结构域分析

基于草莓基因组获得了15个草莓的RPW8同源基因，在数量上多于拟南芥（6个）、油菜（7个）、桃子（12个）和梨（12个），略低于杏[9,11,13](16个），说明RPW8基因在草莓基因组有所扩展，说明草莓基因组中具有较深厚的白粉病抗性潜力，如果加以合理利用，将对草莓的抗病育种有很大贡献。草莓RPW8同源基因主要位于LG5和LG6染色体，仅有个别基因位于其它染色体上，说明在进化上可能由于基因重复、插入、缺失、交换等事件的发生，使RPW8基因得以扩增并发生了序列上的变化。草莓的RPW8同源基因G+C含量（平均42.3%）低于A+T含量（平均57.6%),(A+T)/(G+C)为1.36，该研究结果与杏RPW8同源基因相似[11][G+C含量41.1%,A+T含量58.8%,(A+T)/(G+C)为1.43]，推测(A+T)/(G+C)可能为RPW8基因的核酸序列重要特征之一。

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：3604204