芍药PlSPL3基因的克隆与表达分析

发布时间：2022-02-16 11:23

　　为了探究芍药属不同种间远缘杂交不亲和的分子作用机制,以粉玉奴芍药自交授粉后24 h、36 h和粉玉奴芍药×凤丹白牡丹杂交授粉后24 h、36 h的柱头为材料,根据柱头转录组差异基因序列,采用逆转录（RT）-PCR技术,克隆得到SPL3基因的cDNA序列,将其命名为PlSPL3（GenBank登录号:MN842720）,随后对其进行生物信息学分析和表达特性分析。结果表明,PlSPL3基因的编码区（Coding sequence,CDS）全长1 305 bp,共编码434个氨基酸。分析结果显示,PlSPL3蛋白是一种带负电荷的不稳定的亲水性蛋白质,无跨膜结构。蛋白质进化树显示,芍药PlSPL3蛋白的氨基酸序列与拟南芥AtSPL7蛋白的氨基酸序列具有较高的同源性,同时芍药PlSPL3蛋白与木瓜、向日葵和无花果SPL3蛋白的氨基酸序列同源性也较高。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）结果显示,在自交、杂交授粉后不同时期的柱头中,PlSPL3基因在杂交授粉后36 h的相对表达量最高。研究结果为进一步阐明PlSPL3基因在芍药与牡丹远缘杂交不亲和中的生物学功能提供了理论依据。 

【文章来源】：江苏农业学报. 2020,36(06)北大核心CSCD

【文章页数】：6 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 柱头总RNA的提取和cDNA的合成
        1.2.2 PlSPL3基因的分离克隆
        1.2.3 生物信息学分析
        1.2.4 PlSPL3基因的表达分析
2 结果与分析
    2.1 PlSPL3基因全长序列的克隆与分析
    2.2 PlSPL3基因编码蛋白质理化性质与结构预测
    2.3 PlSPL3同源基因编码蛋白质的氨基酸序列对比与进化树的构建
    2.4 PlSPL3基因的表达分析
3 讨 论


【参考文献】：
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本文编号：3627875