红花檵木LcDRF1和LcDRF2基因克隆及亚细胞定位分析

发布时间：2023-05-19 01:53

　　【目的】克隆红花檵木二氢黄酮醇-4-还原酶(DFR)基因(LcDFR1和LcDFR2),并对其进行亚细胞定位,为揭示红花檵木花青苷的分子合成机理提供理论依据。【方法】基于红花檵木转录组数据,以红花檵木叶片cDNA为模板,RT-PCR克隆LcDFR1和LcDFR2基因开放阅读框(ORF)序列,利用生物信息学软件对其进行分析,并通过烟草叶片瞬时表达方法观察蛋白的亚细胞定位情况。【结果】克隆获得的红花檵木LcDFR1和LcDFR2基因ORF序列分别为1014和993 bp,分别编码337和330个氨基酸残基。LcDFR1与LcDFR2的氨基酸序列相似性为77%,二者与其他物种DFRs氨基酸序列的相似性均较高,其中与葡萄、山核桃、拟南芥等双子叶植物的DFRs氨基酸序列相似性为64%～84%,而与单子叶植物玉米和水稻的DFRs氨基酸序列相似性为58%～61%,表明不同物种DFRs氨基酸序列具有较高的保守性。在基于DFRs氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树上,LcDFR1与牡丹和芍药的DFRs聚为一类,而LcDFR2与烟草和番茄的DFRs聚为一类。结合前人研究结果推测LcDFR1和LcDFR2的...

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【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 RNA提取和第一链c DNA合成
    1.3 Lc DFR1和Lc DFR2基因克隆
    1.4 生物信息学分析
    1.5 植物表达载体构建及亚细胞定位
2 结果与分析
    2.1 Lc DFR1和Lc DFR2基因克隆及序列分析结果
    2.2 同源性比对分析及系统进化树构建结果
    2.3 Lc DFR1和Lc DFR2蛋白三级结构预测结果
    2.4 植物表达载体构建及亚细胞定位结果
3 讨论
4 结论



本文编号：3819425