萝卜病毒病小RNA分析及资源抗性表现

发布时间：2023-11-15 19:24

　　病毒病是为害萝卜的主要病害之一。基于核酸检测的植物病毒病检测技术,因其检测范围广、灵敏度高、适合大批量检测而得以广泛应用。本试验利用小RNA高通量测序方法鉴定萝卜病毒病的种类,并调查分析了264份萝卜核心种质资源及育种品系对病毒病的抗性。结果表明:萝卜病毒病的主要病原为芜菁花叶病毒(TuMV)。参试的核心种质资源和品系多数表现出较好的抗性,且不同品系姊妹系间抗性表现基本趋于一致。田间抗病性调查结果显示:抗病材料有103份,高抗材料有64份,且有25份材料达到免疫。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 病毒病小RNA分析
        1.2.1 总RNA的提取
        1.2.2 构建小RNA文库及反转录合成cDNA
        1.2.3 高通量测序和生物信息学分析
        1.2.4 测序数据质量控制
        1.2.5 sRNA分类注释及拼接
    1.3 萝卜种质资源抗病性调查
        1.3.1 播种及田间管理
        1.3.2 病情分级标准与病情指数调查
2 结果与分析
    2.1 测序数据质量控制及产出
        2.1.1 测序碱基质量值统计
        2.1.2 测序数据产出统计
    2.2 萝卜病毒病种类的分子鉴定
        2.2.1 sRNA分类注释
        2.2.2 sRNA拼接
        2.2.3 拼接contigs分类注释
    2.3 萝卜核心种质资源及育种品系对病毒病的抗性表现
3 结论与讨论
    3.1 萝卜病毒病的分子鉴定
    3.2 萝卜核心种质资源及育种品系对病毒病的抗性表现



本文编号：3864362