贵州辣椒叶脉黄化病毒分离物检测及其P0、CP、MP基因进化分析

发布时间：2024-03-07 03:41

　　为明确辣椒叶脉黄化病毒(Pepper vein yellows virus,PeVYV)在贵州辣椒上的发生分布及其分子变异情况。用RT-PCR法对采自贵州省25个采样地点的548份辣椒疑似病毒病样品进行检测。结果表明:129份为阳性样品,检出率为23.54%。将获得的14个不同采样点PeVYV分离物和已报道的中国和其他国家PeVYV分离物进行序列比对,P0基因核苷酸同源性为90.9%～100.0%,氨基酸相似性为97.7%～100.0%;CP基因核苷酸同源性为93.7%～100.0%,氨基酸相似性为97.9%～100.0%;MP基因核苷酸同源性为94.7%～100.0%,氨基酸相似性均为100.0%。在系统进化树中,有13个采样点PeVYV分离物P0基因聚在一起,与中国分离物(KP326573)的亲缘关系较近,而遵义播州PeVYV分离物与澳大利亚分离物的亲缘关系较近。贵州所有PeVYV分离物CP基因与中国、澳大利亚、美国和西班牙分离物聚为一支,但不同采样点的PeVYV分离物又聚为两个不同的分支。而不同采样点MP基因全部聚在一起,且与其他地区PeVYV分离物的差异不明显。研究结果表明贵州...

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【部分图文】：

图1田间辣椒病毒病叶片症状

调查发现，田间感染辣椒叶脉黄化病毒的辣椒叶片呈现黄化，花叶，扭曲或皱缩，发病后期枝条顶部叶片较小，不生长；整个植株比正常植株矮小（图1）。2.2PeVYVRT-PCR扩增结果

图2PeVYV的P0、CP和MP基因扩增产物图1～14:14个辣椒病毒病样品；15：阴性对照；16：阳性对照。

用引物P0-F/R、CP-F/R和MP-F/R进行RT-PCR扩增，分别能扩增出长度为750、620和470bp的单一PCR产物片段（图2）。2.3PeVYV在贵州辣椒主产区的发生情况

图4基于PeVYV的CP基因的系统进化分析

从PeVYV分离物CP基因的系统进化树（图4）可知：贵州不同采样地点的PeVYV分离物与中国、澳大利亚、美国和西班牙分离物聚为一簇群，其中，长顺、惠水、罗甸、安龙、兴仁、播州和榕江的PeVYV分离物CP基因聚为一亚群，与中国亲缘关系较近。思南、绥阳、贵阳、修文、安顺、平坝和....

图3基于PeVYV的P0基因的系统进化分析

将贵州14个不同采样地检出的PeVYV分离物与已报道世界各地的11个PeVYV分离物的P0、CP和MP基因构建系统进化树，以马铃薯卷叶病毒（Potatoleafrollvirus,PLRV）作为外群。结果表明：采用Neighbor-Joining聚类分析方法将所有Pe....

本文编号：3921335