铜绿假单胞菌毒力相关小RNA的筛选与鉴定
本文关键词:铜绿假单胞菌毒力相关小RNA的筛选与鉴定
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【摘要】:小RNA在细菌的基因调控过程中具有重要的作用,然而目前在铜绿假单胞菌中仅发现了几种有功能的小RNA.铜绿假单胞菌中存在着许多短片段RNA(100-250 bp),然而这些短片段RNA的功能尚不清楚.为了筛选与铜绿假单胞菌毒力相关的小RNA,结合生物信息学手段和实验检测技术对这些短片段RNA进行了靶点基因预测及相关表型研究.结果显示:利用小RNA靶点预测软件,筛选到23个毒力相关小RNA;通过构建小RNA过表达质粒,对这些小RNA进行了高表达及相关的表型检测,发现Pant116对铜绿假单胞菌的3型分泌系统具有负调控作用.
【作者单位】: 南开大学生命科学学院;
【关键词】: 铜绿假单胞菌 小RNA 靶点预测软件 型分泌系统
【基金】:天津市应用基础与前沿技术研究计划(13JCQNJC09500) 南开大学基本科研业务费青年及海外项目
【分类号】:R378
【正文快照】: 0引言铜绿假单胞菌,为革兰氏阴性菌,是一种重要的人类条件致病菌,能够引起严重的医院获得性感染,在免疫力低下人群及囊性肺纤维化病人中容易引起急性和慢性感染,其感染具有难治性与反复性特点.在医院获得性呼吸系统感染以及泌尿系统感染中,铜绿假单胞菌的检出率名列前茅[1].铜
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,本文编号:1007783
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