大鼠牙周炎正畸牙移动初期TNF信号通路的基因本体分析
发布时间:2024-07-11 03:11
目的探究肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路在牙周炎正畸牙移动初期的表达和功能,为牙周炎正畸患者早期炎症反应的调控机制研究提供证据。方法 SD大鼠16只随机分为4组,A组建立双侧上颌第一磨牙牙周炎正畸模型,加力12 h,初始力为80 g;B组仅建立双侧上颌第一磨牙牙周炎模型,不加力;C组对双侧上颌第一磨牙建立健康牙周正畸模型,加力12 h,初始力为80 g;D组为正常大鼠,不作处理(为对照组)。建模及加力完成后,截取各组双侧上颌第一磨牙及牙周组织作为样本进行基因芯片检测,对TNF信号通路相关差异基因进行信号通路富集分析、基因本体(gene ontology,GO)分析和qRT-PCR验证。结果基因芯片结果显示,A、B、C组中TNF信号通路均显著性上调(P <0.01),参与通路的基因在A组有28个上调,5个下调,B组有12个上调,4个下调,C组有12个上调,1个下调(P <0.05)。GO分析中显著性最高的GO条目为"对脂多糖的应答"、"炎症反应"、"NF-κB转录因子活性的正调控"、"NF-κB进入细胞核的正调控"、"对缺氧的应答"(...
【文章页数】:8 页
【文章目录】:
1 材料和方法
1.1 主要试剂和仪器
1.2 实验动物及分组
1.3 建立牙周炎模型
1.4 正畸牙移动模型的建立及取样
1.5 总RNA提取、反转录及基因芯片检测
1.6 生物信息学分析
1.7 qRT-PCR检测
1.8 统计学方法
2 结果
2.1 建模情况
2.2 基因芯片结果
2.3 差异基因GO分析
2.4 q RT-PCR
3 讨论
本文编号:4005162
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1 材料和方法
1.1 主要试剂和仪器
1.2 实验动物及分组
1.3 建立牙周炎模型
1.4 正畸牙移动模型的建立及取样
1.5 总RNA提取、反转录及基因芯片检测
1.6 生物信息学分析
1.7 qRT-PCR检测
1.8 统计学方法
2 结果
2.1 建模情况
2.2 基因芯片结果
2.3 差异基因GO分析
2.4 q RT-PCR
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