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NGAL特异性核酸适配子的筛选及初步应用

发布时间:2024-07-08 20:40
  目的:中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL)是早期诊断和预测急性肾损伤(AKI)的标志物,而且调控多种肿瘤的发生发展。但目前针对NAGL的检测项目并未在临床上广泛开展,也没有以NGAL为靶点蛋白研发的抗肿瘤药物。核酸适配子是一类高特异性高亲和力结合靶标的单链DNA或RNA,在诊断和治疗中广泛应用。本研究拟通过磁珠SELEX,筛选与NGAL高特异性高亲和力结合的核酸适配子,一方面用于建立可广泛推广、简便低廉用于临床诊断的酶联适配子分析(ELAA)检测方法;另一方面,初步探索NGAL特异性核酸适配子能否调节肿瘤细胞的恶性增殖,为抗肿瘤药物研发提供一个新思路。方法:(1)通过磁珠SELEX筛选NGAL特异性核酸适配子,生物信息学方法对适配子进行序列同源性分析和二级结构预测,qPCR法验证比较候选适配子及适配子对NGAL的特异性和亲和力。(2)选取最优适配子A53替换ELISA中的第二个抗体,建立ELAA检测方法,并进行性能评价,包括特异性、线性范围、灵敏度、精密度、准确性及临床样本检测。(3)通过免疫荧光验证A53与食管鳞癌细胞KYSE45表达的NGAL的特异性结合,克隆形成实验和CC...

【文章页数】:72 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

图1磁珠SELEX筛选策略??

图1磁珠SELEX筛选策略??

(2)磁珠SELEX筛选NGAL特异性适配子策略:??本研究的筛选策略是采用蛋白筛选中较为经典成熟的磁珠SELEX来筛选??靶标NGAL的特异性核酸适配子。具体策略如图1:①包被NGAL的磁珠与??ssDNA库孵育进行SELEX筛选,并从第三轮开始在每轮筛选之前加入裸磁珠??进行....


图2?ELAA检测策略??

图2?ELAA检测策略??

或多个适配子及待测靶标形成三明治夹心结构的分析模式,其原理与EL1SA相??似。本研宄用NGAL最优适配子A53替代EL1SA中的第二个抗体建立了?ELAA??检测方法,具体检测策略如图2:①将NGAL抗体包被于96孔板上,用3%?BSA??封闭;②加入NGAL溶液孵育洗涤;③加....


图3,Sllt的DNA库

图3,Sllt的DNA库

第二章材料和方法第二章材料和方法??材料??单链DNA(ssDNA)库的设计和合成??用两端各为20nt的固定的引物互补序列,中间为355nt的封闭型的ssDNA库(图3),库容量大约1021,:??CAGAGGTCAGATG-N35-CCTATGCGTGCTACCG-N-N?N....


图4?NGAL验证及包被结果??A,考马斯亮蓝染色验证NGAL纯度;B,?BCA法测定蛋白包被前后上清溶液蛋白浓度,t??

图4?NGAL验证及包被结果??A,考马斯亮蓝染色验证NGAL纯度;B,?BCA法测定蛋白包被前后上清溶液蛋白浓度,t??

干粉加入500叫ddw溶解后,用Pierce??BCA?Protein?Assay?Kit测其浓度为??1.06明/叫与说明书一致。取lO^LNGAL经12%?SDS?PAGE胶电泳后考马斯亮蓝??染色,结果如图4A,位于25kD左右显示明亮清晰的NGAL条带,条带大小与说??明....



本文编号:4003847

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