2013—2014年南京市流感病毒H3N2亚型血凝素分子遗传特性分析

发布时间：2017-10-19 09:29

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【摘要】：2013—2014年南京市流感病原监测系统分离到31株流感病毒H3N2亚型毒株,通过提取病毒RNA,反转录-聚合酶链反应(reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR)扩增血凝素(hemagglutinin,HA)基因片段,进行PCR产物纯化、测序并分析其遗传进化特征。结果显示,31株分离株与疫苗株A/Texas/50/2012之间的核苷酸和氨基酸进化距离分别为0.010 2和0.012 1,核苷酸和氨基酸的同源性分别为97.9%~99.6%和97.2%~99.3%。遗传进化分析表明,分离株的HA基因分属不同的进化分支,3株2013年分离株属3B基因型,3株2014年分离株属3C.1基因型,2株2014年分离株属3C.2b基因型,其余23株属3C.3a基因型。与疫苗株相比,分离株的分子特征表现为发生N128A/T和P198S/A(去信号肽排列)氨基酸位点变异,均位于抗原决定簇B;分离株抗原决定簇上发生变异的位点共计24个;7株分离株出现126NWT糖基化位点,3株分离株糖基化位点45NSS和144NNS消失。结果提示,2013—2014年南京市流感病毒H3N2亚型的HA基因较疫苗株发生了较大变异,疫苗对病毒的预防效果需重新评估。
【作者单位】： 南京市疾病预防控制中心;江苏省疾病预防控制中心;
【关键词】： 流感病毒HN亚型 血凝素 分子特征
【基金】：国家自然科学基金(81501785) 江苏省自然科学基金(BK20131450) 南京市医学科技发展专项资金(YKK10129)
【分类号】：R373.13
【正文快照】： 自1968年以来,甲型H3N2亚型流感病毒一直是人类季节性流感的重要病原。在人群免疫压力下,抗原漂移成为H3N2亚型变异的主要方式,也是持续引起流行的主要动因[1]。甲型流感病毒抗原变异中,以血凝素(hemagglutinin,HA)基因最重要,分析HA基因序列可在分子水平了解甲型流感病毒的变

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本文编号：1060329