肠道病毒71型湖州分离株的遗传进化和重组分析

发布时间：2017-10-26 15:34

  本文关键词：肠道病毒71型湖州分离株的遗传进化和重组分析

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【摘要】：目的对湖州市肠道病毒71型(EV71)进行基因特征及重组特点分析。方法对2011-2012年湖州市EV71分离株进行全基因组测序,并与其基因型及A组肠道病毒其他血清型的原型株进行全序列比对,使用Mega 4.0软件绘制系统进化树。然后利用Simplot 3.5.1软件进行相似性分析,对基因重组加以验证。结果 P1区系统进化分析显示,2011-2012年湖州市EV71株属于C4基因型的C4a亚型。P1、P2、P3区的系统进化和相似性分析证实湖州市分离株在非结构蛋白2B编码区存在EV71 C基因型和Cox A16、14、4型间重组。结论 2011-2012年湖州市EV71分离株为C4a亚型,与2004年以来中国大陆优势株流行趋势一致。EV71 C4基因型湖州市株存在型间重组现象。
【作者单位】： 湖州市疾病预防控制中心;
【关键词】： 肠道病毒型 系统进化分析 重组
【分类号】：R373
【正文快照】： 作者单位:湖州市疾病预防控制中心,浙江湖州313000Corresponding author:WU Xiao-fang,Email:xf980718@126.com肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)属于小RNA病毒科(picornaviridae)、肠道病毒属(enterovirus),是引起儿童手足口病最常见的病原体之一。病毒基因组仅有一个开放阅

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本文编号：1099305