人乳头瘤病毒编码蛋白的进化分析

发布时间：2017-10-30 19:21

  本文关键词：人乳头瘤病毒编码蛋白的进化分析

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【摘要】：目的构建20种常见高低危型HPV编码蛋白进化树,分析其进化关系。方法从NCBI数据库中获取常见20种高低危型HPV的8种编码蛋白完整氨基酸序列,通过MEGA6.0软件中邻位连接法(neighbor-joining,NJ)构建系统亲缘进化树,进行进化分析。结果低危型HPV6、11和42亚型单独处于一分支上,并与高危型HPV分开。在高危型中,HPV18、39、45、59和68亚型,HPV16、31和35亚型以及HPV33、52和58亚型的HPV基因组8种编码蛋白均分别聚集在同一支上,而高危型HPV73的8种编码蛋白在进化树上的位置均不固定。在构建的E2和E6蛋白进化树中分歧支较多,结果较不可信。结论在蛋白进化树中常见低危型HPV均单独处于一支,且与高危型HPV分开,12个高危型HPV分布于3个不同分支或位置不固定。
【作者单位】： 济南大学山东省医学科学院医学与生命科学学院;山东省医学科学院山东省医药生物技术研究中心;
【关键词】： 人乳头瘤病毒 系统进化树 亲缘关系 结构蛋白
【分类号】：R373
【正文快照】： *?宫颈癌是女性最常见癌症之一,在我国已取代乳腺癌成为女性死亡的首位恶性肿瘤[1-2]。研究表明,99%的宫颈癌与人类乳头瘤病毒(HPV)感染有关[3]。HPV是一种无包膜的双链环状DNA病毒,目前已发现的HPV亚型有200多种[4],根据HPV致病力的大小分为高危型与低危型[5-6]。高危型包括H

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