SARS-CoV、SARSL-CoV与其他冠状病毒的种系发生分析

发布时间：2017-11-07 02:15

  本文关键词：SARS-CoV、SARSL-CoV与其他冠状病毒的种系发生分析

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【摘要】：目的分析不同流行时段重症急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndromes coronavirus,SARS-CoV)病毒株与重症急性呼吸综合征样冠状病毒(severe acute respiratory syndromes like coronavirus,SARSLCoV)及其他冠状病毒的分子进化关系。方法从美国国立生物技术信息中心获取不同分离时段的SARS-CoV(9条)、所有SARSL-CoV(24条)、其他冠状病毒(26条)的全基因组序列,用Clustal X 2.1软件进行多重序列比对,用邻接法(neighbor-joining,NJ)MEGA 6.0软件构建系统进化树。结果在包含SARS-CoV、SARSL-CoV和其他冠状病毒基因组序列的不同数据集中,流行早、中期SARS-CoV与流行末期毒株的基因组序列均分别属于不同的分支;以流行早、中期SARS-CoV为根的有根树显示,流行末期SARS-CoV遗传距离最远,而与SARSL-CoV和其他冠状病毒遗传距离更接近。结论流行末期SARS-CoV与流行早、中期SARS-CoV遗传差异大,且可能存在逆向/返祖进化。
【作者单位】： 郑州大学公共卫生学院环境卫生学教研室;广东省疾病预防控制中心传染病预防控制所;第四军医大学预防系流行病学教研室;新乡医学院河南省分子诊断与医学检验技术协同创新中心;
【基金】：国家自然科学基金(81373059)
【分类号】：R373
【正文快照】： 2003年4月,世界卫生组织宣布重症急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndromes,SARS)的病因为一种新型冠状病毒,即重症急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndromes corona-virus,SARS-Co V)。此后人们对SARS-Co V的起源与进化进行了探索,但自2003-2004，

本文编号：1150400