结核分枝杆菌MT3876蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-11-13 19:04

  本文关键词：结核分枝杆菌MT3876蛋白的生物信息学分析

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【摘要】：目的应用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌MT3876基因编码的蛋白质结构和功能。方法从NCBI数据库获取MT3876基本的基因信息;应用ProParam预测MT3876蛋白的理化性质;应用SignalP 4.0及TMHMM分析其信号肽及跨膜区;利用在线分析Expasy工具分析蛋白二级结构并建立蛋白的三级结构模型;利用ABCpred、SYFPEITHI及NetMHCIIpan 3.1Server分析蛋白抗原表位,寻找最佳B细胞及T细胞抗原位点。结果 MT3876编码结核分枝杆菌假想蛋白MT3876具有172个氨基酸残基。该蛋白无信号肽,位于胞壁,跨膜结构不明显。二级结构中无规卷曲约占52.33%,结构疏松。MT3876具有潜在的B细胞抗原表75~90、103~118、17~32、140~155、96~113、123~142及37~54等位点,T细胞抗原表位1~10、80~88、114~118、133~141及149~172等。结论生物信息学预测MT3876基因编码的蛋白质具有潜在的B、T细胞抗原表位,可作为研发免疫诊断方法的侯选分子靶标。
【作者单位】： 潍坊医学院医学检验学系;潍坊医学院病原生物学教研室;
【基金】：国家自然科学基金项目(No.81170080,81470001) 潍坊医学院2011年科技创新前沿探索重点研究项目(No.K11TS1004)
【分类号】：R378.911
【正文快照】： ***结核病是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuber-culosis,MTB)引起的慢性传染性疾病。世界卫生组织结核报告中指出2014年全球150万人死于结核病,其中包括40万HIV阳性的结核病患者。近年来,由于多耐药性结核分枝杆菌菌株的出现和HIV感染导致的免疫力低下人群增多,使得结核病发

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本文编号：1181969