新发虫媒病毒:基因A型版纳病毒全基因组序列扩增引物

发布时间：2017-11-28 11:30

  本文关键词：新发虫媒病毒:基因A型版纳病毒全基因组序列扩增引物

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【摘要】：目的设计版纳病毒型别特异性测序引物,为构建快速高效经济的版纳病毒全基因组测序平台奠定基础。方法根据Gen Bank已知的版纳病毒基因序列信息进行基因型分析,采用Primer Premier v6.0及Oligo 7.56软件完成版纳病毒亚型特异性扩增引物的设计与评估。使用中国分离的30株版纳病毒进行版纳病毒型别特异性引物工作效率验证和评估。结果通过对30株隶属于2个不同基因亚型的版纳病毒开展全基因组序列测定,获得2套型别工作效率高、扩增效果稳定的基因A型特异性版纳病毒全基因组序列扩增测序引物。基因A1亚型引物一套共26对;基因A2亚型引物一套共计30对。完成了30株版纳病毒全基因组序列扩增。结论设计的版纳病毒型别特异性扩增测序引物可以高效准确地完成版纳病毒全基因组序列扩增,为进一步深入研究版纳病毒分子生物学特征奠定了基础。
【作者单位】： 山东理工大学生命科学学院生物技术系;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒性脑炎室传染病预防控制国家重点实验室;
【基金】：国家自然科学基金重大项目(81290342);国家自然科学基金(81301479,81501757) 山东省自然科学基金(ZR2013HQ008) 传染病预防和控制重点实验室发展项目(2014SKLID103)~~
【分类号】：R373
【正文快照】： 版纳病毒是呼肠孤病毒科新建立的Seadornavirus病毒属的模式病毒[1]。该病毒于1987年首次从我国病毒性脑炎患者中分离[2],此后相继在多种动物宿主和蚊虫媒介中分离[3],广泛分布在我国和东南亚 地区,2013年,版纳样病毒在匈牙利巴拉顿湖的淡水鲤鱼中分离[4]。版纳病毒宿主媒介

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1 刘红;梁国栋;;版纳病毒及其感染[J];中国媒介生物学及控制杂志;2010年05期

2 孟维珊;李铭华;付士红;张稷博;张立田;陈哲;丁俊;梁国栋;;辽宁省丹东市鸭绿江沿岸2007年虫媒病毒分离鉴定[J];中国媒介生物学及控制杂志;2012年05期

3 曹玉玺;付士红;张稷博;孟维珊;王焕琴;何英;王环宇;郭军巧;梁国栋;;辽宁省部分地区2008年虫媒病毒分离鉴定[J];中国媒介生物学及控制杂志;2012年02期

4 徐丽宏;梁国栋;;引起人类脑炎的新双链RNA病毒[J];中华实验和临床病毒学杂志;2006年03期

5 ;[J];;年期

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1 刘红;版纳病毒全基因组序列特征及其分子进化研究[D];中国疾病预防控制中心;2011年

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本文编号：1233833