扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测

发布时间：2017-12-13 09:10

  本文关键词：扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测

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【摘要】：目的建立一种快速准确检测扎伊尔型埃博拉病毒(Zaire ebola virus,ZEBOV)的方法。方法以2014年西非新分离的3株ZEBOV全基因组参考序列及1976年从Mayinga分离的ZEBOV株(NC_002549)为目标,基于Insignia系统算法与GenBank中Nt库比对,求出ZEBOV特异性核酸标签序列。设计引物、TaqMan探针和优化反应条件,以10倍系列稀释的阳性质粒做标准曲线,做准确性、重复性实验。并以其余4个亚型的埃博拉病毒、马尔堡病毒、西尼罗河热病毒、东方马脑炎病毒、西方马脑炎病毒等8种病毒对照及临床48例患者复杂样本为对照做特异性检测。结果选择比对得到的特异性标签序列(KJ660348,11331-11514)设计探针引物,标准曲线相关系数0.99,灵敏度可达5×10~1拷贝。准确性重复性实验结果批内变异系数(CV)为0.88%~2.50%、批间CV为1.75%~3.31%。8种病毒及临床48例患者复杂样本对照均为阴性。结论 ZEBOV核酸标签(KJ660348,11331-11514)在非编码区,在此基础上建立的荧光定量PCR方法可特异性检测ZEBOV,且灵敏、重复性好。
【作者单位】： 第三军医大学西南医院全军感染病研究所 感染病研究重庆市重点实验室;重庆大学计算机学院;解放军77128部队;中国科学院计算技术研究所;
【基金】：全军后勤科研“十二五”计划重大项目(AWS11C001) 西南医院军事医学预研专项资助课题(SWH2013JS03)~~
【分类号】：R373;R440
【正文快照】： 埃博拉病毒病是由埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)感染引起的一种烈性传染病,主要以人和非人类灵长类动物易感,致死率高达25%~90%[1-3]。临床以发热及出血为主要特征,表现为急性起病、发热、肌痛、出血、皮疹和以肝、肾为代表的多器官损伤[4]。EBOV属于丝状病毒科(Filoviridae)

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1 ;埃博拉病毒[J];国外畜牧科技;2001年06期

2 杨涛;埃博拉病毒的研究概况[J];国外医学.病毒学分册;2002年05期

3 孙玉兰,李德新;埃博拉病毒结构蛋白研究进展[J];中华实验和临床病毒学杂志;2004年04期

4 ;干扰埃博拉病毒繁殖突破性进展[J];临床合理用药杂志;2010年12期

5 ;美科学家揭开埃博拉病毒之谜[J];生物学教学;2014年01期

6 卞文;埃博拉病毒肆虐[J];国外科技动态;1996年11期

7 ;何谓埃博拉病毒[J];山西教育;2001年10期

8 杨世诚;前度“刘愞”今又来——埃博拉病毒的来龙去脉[J];百科知识;2001年02期

9 李潇;埃博拉病毒糖蛋白致命之谜[J];生物化学与生物物理学报;2001年01期

10 聂福平;范泉水;王灵强;郄翠仙;郭松辉;龙贵伟;李丽红;张念祖;;埃博拉病毒的研究进展[J];中国畜牧兽医;2006年10期

中国重要会议论文全文数据库 前3条

1 李霄;金宁一;米志强;;埃博拉病毒疫苗及其治疗方法相关研究进展[A];人畜共患传染病防治研究新成果汇编[C];2004年

2 张振清;袁志明;;卡尔扎伊型埃博拉病毒的重组病毒疫苗研究[A];2013年湖北省暨武汉微生物学会会员代表大会暨学术年会论文摘要集[C];2013年

3 夏咸柱;;野生动物疫病与公共卫生[A];中国畜牧兽医学会养犬学分会第十二次全国养犬学术研讨会论文集[C];2007年

中国重要报纸全文数据库 前10条

1 张忠霞;非洲数千大猩猩死于埃博拉病毒[N];人民日报;2006年

2 ;美研究人员发现猪感染埃博拉病毒[N];新华每日电讯;2009年

3 王文成;埃博拉病毒加速大型类人猿灭亡[N];新华每日电讯;2005年

4 王雯婷;埃博拉病毒扯动世界[N];人民日报海外版;2014年

5 杜鹃;埃博拉病毒六问[N];新华每日电讯;2014年

6 本报记者 项铮;我国三道防线严防埃博拉病毒[N];科技日报;2014年

7 本报记者 吴越;气候因素催生埃博拉病毒？[N];中国气象报;2014年

8 记者 王玉凤;埃博拉病毒“复活” 全球严防[N];第一财经日报;2014年

9 张忠霞;埃博拉病毒为何难降服[N];健康报;2014年

10 徐蔚冰;埃博拉病毒离我们有多远[N];中国经济时报;2014年

中国硕士学位论文全文数据库 前5条

1 陈雯雯;“埃博拉病毒医学护理建议”汉译项目报告[D];南京师范大学;2015年

2 盖微微;致死型埃博拉病毒核酸和抗体检测方法的建立[D];吉林农业大学;2014年

3 赵晨;埃博拉病毒糖蛋白的毒性研究[D];北京协和医学院;2011年

4 张桂根;埃博拉病毒包膜蛋白GP细胞毒性机理研究[D];北京协和医学院;2011年

5 刘阳;荧光定量RT-PCR检测埃博拉病毒方法的建立[D];黑龙江大学;2012年

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