厦门市临床分离的466株结核分枝杆菌基因分型研究

发布时间：2017-12-16 08:06

  本文关键词：厦门市临床分离的466株结核分枝杆菌基因分型研究

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【摘要】：目的了解厦门市结核分枝杆菌基因类型分布及主要流行基因群情况,并建立分型数据库。方法采用实时荧光PCR法对厦门市2013-2015年分离到的466株结核分枝杆菌临床分离株进行菌株确认,然后采用间隔区寡核苷酸分型方法(spoligotyping)对其进行基因分型。分型结果与Spol DB4数据库进行比对,并使用Bionumeric6.6.4软件进行基因聚类分析。结果 466株菌均为结核分枝杆菌,基因分型分成96种基因型别,62种数据库中有相应的SIT编号,34种为新的型别。97.64%(455/466)的菌构成了15个基因簇。466株菌属于7个基因家族及未定义家族,排在前三的分别为:Beijing(北京)家族60.09%(280/466)、T家族21.03%(98/466)、H家族5.58%(26/466)。结论厦门市结核分枝杆菌基因型别呈现多样性,北京家族为主要的流行基因群。
【作者单位】： 厦门市疾病预防控制中心;厦门大学生命科学学院;厦门大学附属中山医院;
【基金】：国家高技术研究发展计划(863计划)“结核分枝杆菌的高通量溯源关键技术和产品的研究2014AA021401” 厦门市医学中心/重点专科项目
【分类号】：R378.911
【正文快照】： 结核病是一种古老的疾病,对其病原菌的认识是从分离培养等表型研究开始,到现在已经从基因水平上对其进行分类分型研究。结核分枝杆菌的分型研究发现,染色体DNA多态性与其流行病学研究密切相关,比如结核病暴发调查,追踪和寻觅传染源,社区传播,耐多药克隆株的播散,而其多态性与D

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本文编号：1295278